Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRIK1P39086 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRIK1P39086 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRIK1P39086 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIK1P39086 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIK1P39086 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIK1P39086 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIK1P39086 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIK1P39086 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIK1P39086 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIK1P39086 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIK1P39086 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIK1P39086 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIK1P39086 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIK1P39086 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIK1P39086 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIK1P39086 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIK1P39086 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIK1P39086 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIK1P39086 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIK1P39086 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GRIK1P39086 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GRIK1P39086 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GRIK1P39086 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GRIK1P39086 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GRIK1P39086 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GRIK1P39086 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIK1P39086 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIK1P39086 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIK1P39086 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIK1P39086 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIK1P39086 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GRIK1P39086 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GRIK1P39086 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GRIK1P39086 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GRIK1P39086 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GRIK1P39086 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIK1P39086 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIK1P39086 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIK1P39086 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIK1P39086 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIK1P39086 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIK1P39086 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIK1P39086 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIK1P39086 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIK1P39086 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIK1P39086 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIK1P39086 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIK1P39086 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIK1P39086 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIK1P39086 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIK1P39086 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIK1P39086 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIK1P39086 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIK1P39086 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIK1P39086 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIK1P39086 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIK1P39086 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIK1P39086 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIK1P39086 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIK1P39086 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIK1P39086 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIK1P39086 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIK1P39086 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIK1P39086 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIK1P39086 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIK1P39086 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIK1P39086 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIK1P39086 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIK1P39086 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIK1P39086 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIK1P39086 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIK1P39086 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIK1P39086 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIK1P39086 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIK1P39086 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIK1P39086 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIK1P39086 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIK1P39086 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIK1P39086 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIK1P39086 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIK1P39086 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIK1P39086 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIK1P39086 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIK1P39086 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIK1P39086 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIK1P39086 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIK1P39086 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIK1P39086 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIK1P39086 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIK1P39086 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIK1P39086 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIK1P39086 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIK1P39086 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIK1P39086 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIK1P39086 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIK1P39086 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIK1P39086 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIK1P39086 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIK1P39086 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms