Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCKBRP32239 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCKBRP32239 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCKBRP32239 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCKBRP32239 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCKBRP32239 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCKBRP32239 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCKBRP32239 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCKBRP32239 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCKBRP32239 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCKBRP32239 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCKBRP32239 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCKBRP32239 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCKBRP32239 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCKBRP32239 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCKBRP32239 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCKBRP32239 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCKBRP32239 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCKBRP32239 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCKBRP32239 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCKBRP32239 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCKBRP32239 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCKBRP32239 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCKBRP32239 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCKBRP32239 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCKBRP32239 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCKBRP32239 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCKBRP32239 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCKBRP32239 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCKBRP32239 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCKBRP32239 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCKBRP32239 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCKBRP32239 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCKBRP32239 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCKBRP32239 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCKBRP32239 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCKBRP32239 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCKBRP32239 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCKBRP32239 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCKBRP32239 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCKBRP32239 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCKBRP32239 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCKBRP32239 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCKBRP32239 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCKBRP32239 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCKBRP32239 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCKBRP32239 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCKBRP32239 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCKBRP32239 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCKBRP32239 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCKBRP32239 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCKBRP32239 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCKBRP32239 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCKBRP32239 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCKBRP32239 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCKBRP32239 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCKBRP32239 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCKBRP32239 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCKBRP32239 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCKBRP32239 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCKBRP32239 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCKBRP32239 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCKBRP32239 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCKBRP32239 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCKBRP32239 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCKBRP32239 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCKBRP32239 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCKBRP32239 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCKBRP32239 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCKBRP32239 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCKBRP32239 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCKBRP32239 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCKBRP32239 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCKBRP32239 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCKBRP32239 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCKBRP32239 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCKBRP32239 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCKBRP32239 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCKBRP32239 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCKBRP32239 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCKBRP32239 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCKBRP32239 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCKBRP32239 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCKBRP32239 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCKBRP32239 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCKBRP32239 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCKBRP32239 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCKBRP32239 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCKBRP32239 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCKBRP32239 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCKBRP32239 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCKBRP32239 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCKBRP32239 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCKBRP32239 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCKBRP32239 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCKBRP32239 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCKBRP32239 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCKBRP32239 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCKBRP32239 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCKBRP32239 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms