Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SERPINB3P29508 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SERPINB3P29508 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SERPINB3P29508 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SERPINB3P29508 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SERPINB3P29508 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SERPINB3P29508 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SERPINB3P29508 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SERPINB3P29508 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SERPINB3P29508 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SERPINB3P29508 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SERPINB3P29508 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SERPINB3P29508 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SERPINB3P29508 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SERPINB3P29508 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SERPINB3P29508 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SERPINB3P29508 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SERPINB3P29508 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SERPINB3P29508 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SERPINB3P29508 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SERPINB3P29508 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SERPINB3P29508 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SERPINB3P29508 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SERPINB3P29508 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SERPINB3P29508 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SERPINB3P29508 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SERPINB3P29508 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SERPINB3P29508 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SERPINB3P29508 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SERPINB3P29508 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SERPINB3P29508 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SERPINB3P29508 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SERPINB3P29508 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SERPINB3P29508 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SERPINB3P29508 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SERPINB3P29508 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SERPINB3P29508 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SERPINB3P29508 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SERPINB3P29508 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SERPINB3P29508 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SERPINB3P29508 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SERPINB3P29508 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SERPINB3P29508 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SERPINB3P29508 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SERPINB3P29508 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SERPINB3P29508 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SERPINB3P29508 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SERPINB3P29508 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SERPINB3P29508 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SERPINB3P29508 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SERPINB3P29508 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SERPINB3P29508 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SERPINB3P29508 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SERPINB3P29508 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SERPINB3P29508 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SERPINB3P29508 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SERPINB3P29508 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SERPINB3P29508 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SERPINB3P29508 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SERPINB3P29508 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SERPINB3P29508 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SERPINB3P29508 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SERPINB3P29508 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SERPINB3P29508 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SERPINB3P29508 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SERPINB3P29508 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SERPINB3P29508 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SERPINB3P29508 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SERPINB3P29508 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SERPINB3P29508 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SERPINB3P29508 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SERPINB3P29508 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SERPINB3P29508 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SERPINB3P29508 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SERPINB3P29508 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SERPINB3P29508 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SERPINB3P29508 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SERPINB3P29508 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SERPINB3P29508 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SERPINB3P29508 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SERPINB3P29508 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SERPINB3P29508 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SERPINB3P29508 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SERPINB3P29508 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SERPINB3P29508 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SERPINB3P29508 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SERPINB3P29508 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SERPINB3P29508 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SERPINB3P29508 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SERPINB3P29508 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SERPINB3P29508 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SERPINB3P29508 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SERPINB3P29508 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SERPINB3P29508 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SERPINB3P29508 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SERPINB3P29508 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SERPINB3P29508 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SERPINB3P29508 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SERPINB3P29508 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SERPINB3P29508 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms