Protein–RNA interactions for Protein: P22314

UBA1, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA1P22314 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
UBA1P22314 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
UBA1P22314 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
UBA1P22314 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
UBA1P22314 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
UBA1P22314 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
UBA1P22314 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
UBA1P22314 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
UBA1P22314 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
UBA1P22314 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
UBA1P22314 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UBA1P22314 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
UBA1P22314 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
UBA1P22314 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UBA1P22314 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBA1P22314 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBA1P22314 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBA1P22314 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBA1P22314 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBA1P22314 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
UBA1P22314 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
UBA1P22314 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
UBA1P22314 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
UBA1P22314 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UBA1P22314 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
UBA1P22314 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UBA1P22314 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
UBA1P22314 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
UBA1P22314 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UBA1P22314 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
UBA1P22314 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
UBA1P22314 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
UBA1P22314 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
UBA1P22314 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
UBA1P22314 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
UBA1P22314 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
UBA1P22314 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
UBA1P22314 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBA1P22314 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBA1P22314 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBA1P22314 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBA1P22314 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBA1P22314 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
UBA1P22314 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
UBA1P22314 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
UBA1P22314 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
UBA1P22314 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
UBA1P22314 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
UBA1P22314 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBA1P22314 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBA1P22314 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBA1P22314 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
UBA1P22314 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBA1P22314 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBA1P22314 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBA1P22314 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
UBA1P22314 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBA1P22314 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBA1P22314 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBA1P22314 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBA1P22314 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBA1P22314 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
UBA1P22314 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBA1P22314 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBA1P22314 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBA1P22314 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBA1P22314 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBA1P22314 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBA1P22314 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBA1P22314 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBA1P22314 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBA1P22314 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBA1P22314 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBA1P22314 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBA1P22314 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBA1P22314 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBA1P22314 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBA1P22314 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBA1P22314 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBA1P22314 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBA1P22314 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
UBA1P22314 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBA1P22314 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBA1P22314 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBA1P22314 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBA1P22314 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBA1P22314 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBA1P22314 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
UBA1P22314 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UBA1P22314 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UBA1P22314 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UBA1P22314 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UBA1P22314 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
UBA1P22314 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UBA1P22314 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
UBA1P22314 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UBA1P22314 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UBA1P22314 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
UBA1P22314 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
UBA1P22314 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms