Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ARF4P18085 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARF4P18085 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARF4P18085 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARF4P18085 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARF4P18085 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARF4P18085 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARF4P18085 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARF4P18085 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARF4P18085 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARF4P18085 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARF4P18085 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARF4P18085 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ARF4P18085 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARF4P18085 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARF4P18085 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARF4P18085 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARF4P18085 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARF4P18085 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARF4P18085 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARF4P18085 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARF4P18085 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARF4P18085 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARF4P18085 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ARF4P18085 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARF4P18085 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARF4P18085 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARF4P18085 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARF4P18085 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARF4P18085 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
ARF4P18085 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ARF4P18085 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ARF4P18085 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ARF4P18085 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ARF4P18085 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARF4P18085 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARF4P18085 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARF4P18085 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ARF4P18085 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ARF4P18085 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ARF4P18085 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ARF4P18085 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ARF4P18085 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ARF4P18085 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ARF4P18085 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ARF4P18085 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARF4P18085 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARF4P18085 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ARF4P18085 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARF4P18085 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ARF4P18085 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARF4P18085 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARF4P18085 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
ARF4P18085 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ARF4P18085 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ARF4P18085 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARF4P18085 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARF4P18085 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARF4P18085 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARF4P18085 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARF4P18085 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARF4P18085 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARF4P18085 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARF4P18085 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARF4P18085 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARF4P18085 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARF4P18085 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARF4P18085 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARF4P18085 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARF4P18085 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARF4P18085 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARF4P18085 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARF4P18085 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARF4P18085 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARF4P18085 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARF4P18085 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARF4P18085 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARF4P18085 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARF4P18085 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARF4P18085 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARF4P18085 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARF4P18085 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARF4P18085 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARF4P18085 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARF4P18085 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARF4P18085 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARF4P18085 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARF4P18085 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ARF4P18085 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ARF4P18085 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARF4P18085 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARF4P18085 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARF4P18085 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARF4P18085 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARF4P18085 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARF4P18085 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARF4P18085 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARF4P18085 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARF4P18085 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARF4P18085 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms