Protein–RNA interactions for Protein: P17040

ZSCAN20, Zinc finger and SCAN domain-containing protein 20, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSCAN20P17040 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZSCAN20P17040 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZSCAN20P17040 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZSCAN20P17040 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZSCAN20P17040 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZSCAN20P17040 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZSCAN20P17040 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZSCAN20P17040 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZSCAN20P17040 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ZSCAN20P17040 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZSCAN20P17040 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZSCAN20P17040 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZSCAN20P17040 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZSCAN20P17040 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZSCAN20P17040 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZSCAN20P17040 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZSCAN20P17040 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZSCAN20P17040 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZSCAN20P17040 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZSCAN20P17040 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZSCAN20P17040 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZSCAN20P17040 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZSCAN20P17040 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZSCAN20P17040 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZSCAN20P17040 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ZSCAN20P17040 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZSCAN20P17040 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZSCAN20P17040 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZSCAN20P17040 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZSCAN20P17040 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZSCAN20P17040 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZSCAN20P17040 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZSCAN20P17040 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZSCAN20P17040 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZSCAN20P17040 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZSCAN20P17040 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ZSCAN20P17040 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ZSCAN20P17040 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZSCAN20P17040 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZSCAN20P17040 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZSCAN20P17040 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZSCAN20P17040 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZSCAN20P17040 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZSCAN20P17040 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZSCAN20P17040 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZSCAN20P17040 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZSCAN20P17040 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZSCAN20P17040 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZSCAN20P17040 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZSCAN20P17040 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZSCAN20P17040 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZSCAN20P17040 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZSCAN20P17040 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZSCAN20P17040 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZSCAN20P17040 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZSCAN20P17040 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZSCAN20P17040 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZSCAN20P17040 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZSCAN20P17040 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZSCAN20P17040 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZSCAN20P17040 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ZSCAN20P17040 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZSCAN20P17040 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZSCAN20P17040 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ZSCAN20P17040 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZSCAN20P17040 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZSCAN20P17040 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZSCAN20P17040 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZSCAN20P17040 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZSCAN20P17040 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZSCAN20P17040 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZSCAN20P17040 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZSCAN20P17040 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZSCAN20P17040 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZSCAN20P17040 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZSCAN20P17040 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZSCAN20P17040 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZSCAN20P17040 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZSCAN20P17040 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZSCAN20P17040 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZSCAN20P17040 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZSCAN20P17040 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZSCAN20P17040 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZSCAN20P17040 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZSCAN20P17040 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZSCAN20P17040 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZSCAN20P17040 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ZSCAN20P17040 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ZSCAN20P17040 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZSCAN20P17040 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZSCAN20P17040 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ZSCAN20P17040 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZSCAN20P17040 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZSCAN20P17040 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZSCAN20P17040 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZSCAN20P17040 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZSCAN20P17040 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZSCAN20P17040 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZSCAN20P17040 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZSCAN20P17040 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms