Protein–RNA interactions for Protein: P12319

FCER1A, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCER1AP12319 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FCER1AP12319 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FCER1AP12319 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FCER1AP12319 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FCER1AP12319 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FCER1AP12319 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FCER1AP12319 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
FCER1AP12319 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FCER1AP12319 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FCER1AP12319 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FCER1AP12319 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FCER1AP12319 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FCER1AP12319 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FCER1AP12319 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FCER1AP12319 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FCER1AP12319 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FCER1AP12319 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FCER1AP12319 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FCER1AP12319 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FCER1AP12319 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FCER1AP12319 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FCER1AP12319 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FCER1AP12319 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FCER1AP12319 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FCER1AP12319 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FCER1AP12319 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FCER1AP12319 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FCER1AP12319 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FCER1AP12319 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FCER1AP12319 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FCER1AP12319 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FCER1AP12319 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FCER1AP12319 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FCER1AP12319 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
FCER1AP12319 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
FCER1AP12319 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FCER1AP12319 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
FCER1AP12319 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FCER1AP12319 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FCER1AP12319 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
FCER1AP12319 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FCER1AP12319 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FCER1AP12319 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
FCER1AP12319 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FCER1AP12319 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FCER1AP12319 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FCER1AP12319 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FCER1AP12319 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FCER1AP12319 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FCER1AP12319 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FCER1AP12319 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FCER1AP12319 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FCER1AP12319 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FCER1AP12319 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FCER1AP12319 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FCER1AP12319 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FCER1AP12319 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FCER1AP12319 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FCER1AP12319 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FCER1AP12319 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
FCER1AP12319 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FCER1AP12319 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FCER1AP12319 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
FCER1AP12319 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FCER1AP12319 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FCER1AP12319 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FCER1AP12319 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
FCER1AP12319 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
FCER1AP12319 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FCER1AP12319 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FCER1AP12319 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FCER1AP12319 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FCER1AP12319 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FCER1AP12319 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FCER1AP12319 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FCER1AP12319 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FCER1AP12319 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FCER1AP12319 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FCER1AP12319 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FCER1AP12319 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FCER1AP12319 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FCER1AP12319 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FCER1AP12319 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
FCER1AP12319 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
FCER1AP12319 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FCER1AP12319 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
FCER1AP12319 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FCER1AP12319 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
FCER1AP12319 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FCER1AP12319 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FCER1AP12319 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FCER1AP12319 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FCER1AP12319 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FCER1AP12319 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FCER1AP12319 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FCER1AP12319 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FCER1AP12319 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
FCER1AP12319 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FCER1AP12319 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
FCER1AP12319 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms