Protein–RNA interactions for Protein: P0CI25

TRIM49, Tripartite motif-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49P0CI25 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM49P0CI25 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM49P0CI25 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM49P0CI25 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM49P0CI25 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM49P0CI25 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRIM49P0CI25 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM49P0CI25 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM49P0CI25 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM49P0CI25 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM49P0CI25 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM49P0CI25 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM49P0CI25 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM49P0CI25 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM49P0CI25 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM49P0CI25 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM49P0CI25 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM49P0CI25 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM49P0CI25 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM49P0CI25 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM49P0CI25 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM49P0CI25 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM49P0CI25 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM49P0CI25 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM49P0CI25 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM49P0CI25 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM49P0CI25 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM49P0CI25 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM49P0CI25 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM49P0CI25 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM49P0CI25 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM49P0CI25 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM49P0CI25 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM49P0CI25 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM49P0CI25 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM49P0CI25 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM49P0CI25 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM49P0CI25 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM49P0CI25 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM49P0CI25 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM49P0CI25 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM49P0CI25 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM49P0CI25 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM49P0CI25 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM49P0CI25 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM49P0CI25 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM49P0CI25 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM49P0CI25 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM49P0CI25 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM49P0CI25 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM49P0CI25 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM49P0CI25 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM49P0CI25 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM49P0CI25 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM49P0CI25 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM49P0CI25 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM49P0CI25 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM49P0CI25 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM49P0CI25 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM49P0CI25 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM49P0CI25 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM49P0CI25 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM49P0CI25 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM49P0CI25 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM49P0CI25 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM49P0CI25 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM49P0CI25 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM49P0CI25 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM49P0CI25 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM49P0CI25 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM49P0CI25 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM49P0CI25 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM49P0CI25 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM49P0CI25 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM49P0CI25 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM49P0CI25 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM49P0CI25 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM49P0CI25 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM49P0CI25 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM49P0CI25 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM49P0CI25 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM49P0CI25 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM49P0CI25 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM49P0CI25 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM49P0CI25 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM49P0CI25 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM49P0CI25 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM49P0CI25 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM49P0CI25 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM49P0CI25 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM49P0CI25 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM49P0CI25 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM49P0CI25 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM49P0CI25 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM49P0CI25 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM49P0CI25 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM49P0CI25 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM49P0CI25 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM49P0CI25 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM49P0CI25 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.7 ms