Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EIF3JO75822 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EIF3JO75822 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EIF3JO75822 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
EIF3JO75822 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EIF3JO75822 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EIF3JO75822 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
EIF3JO75822 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
EIF3JO75822 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EIF3JO75822 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EIF3JO75822 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EIF3JO75822 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EIF3JO75822 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
EIF3JO75822 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EIF3JO75822 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EIF3JO75822 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
EIF3JO75822 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EIF3JO75822 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EIF3JO75822 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EIF3JO75822 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EIF3JO75822 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EIF3JO75822 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
EIF3JO75822 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EIF3JO75822 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EIF3JO75822 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EIF3JO75822 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EIF3JO75822 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EIF3JO75822 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EIF3JO75822 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
EIF3JO75822 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EIF3JO75822 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EIF3JO75822 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EIF3JO75822 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EIF3JO75822 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EIF3JO75822 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EIF3JO75822 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EIF3JO75822 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
EIF3JO75822 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
EIF3JO75822 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EIF3JO75822 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EIF3JO75822 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
EIF3JO75822 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EIF3JO75822 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EIF3JO75822 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EIF3JO75822 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EIF3JO75822 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EIF3JO75822 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EIF3JO75822 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EIF3JO75822 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EIF3JO75822 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EIF3JO75822 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EIF3JO75822 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EIF3JO75822 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EIF3JO75822 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EIF3JO75822 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EIF3JO75822 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EIF3JO75822 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EIF3JO75822 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EIF3JO75822 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
EIF3JO75822 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
EIF3JO75822 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
EIF3JO75822 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EIF3JO75822 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
EIF3JO75822 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
EIF3JO75822 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EIF3JO75822 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EIF3JO75822 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
EIF3JO75822 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EIF3JO75822 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EIF3JO75822 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EIF3JO75822 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EIF3JO75822 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EIF3JO75822 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EIF3JO75822 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EIF3JO75822 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EIF3JO75822 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EIF3JO75822 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
EIF3JO75822 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EIF3JO75822 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EIF3JO75822 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
EIF3JO75822 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EIF3JO75822 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EIF3JO75822 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EIF3JO75822 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EIF3JO75822 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EIF3JO75822 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EIF3JO75822 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EIF3JO75822 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EIF3JO75822 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EIF3JO75822 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EIF3JO75822 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EIF3JO75822 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EIF3JO75822 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EIF3JO75822 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EIF3JO75822 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EIF3JO75822 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EIF3JO75822 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EIF3JO75822 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EIF3JO75822 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EIF3JO75822 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms