Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
IGSF3O75054 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
IGSF3O75054 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
IGSF3O75054 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
IGSF3O75054 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
IGSF3O75054 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
IGSF3O75054 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
IGSF3O75054 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
IGSF3O75054 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
IGSF3O75054 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
IGSF3O75054 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
IGSF3O75054 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
IGSF3O75054 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
IGSF3O75054 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
IGSF3O75054 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
IGSF3O75054 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
IGSF3O75054 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
IGSF3O75054 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
IGSF3O75054 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
IGSF3O75054 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
IGSF3O75054 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
IGSF3O75054 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
IGSF3O75054 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
IGSF3O75054 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
IGSF3O75054 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
IGSF3O75054 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
IGSF3O75054 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
IGSF3O75054 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
IGSF3O75054 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
IGSF3O75054 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
IGSF3O75054 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
IGSF3O75054 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
IGSF3O75054 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
IGSF3O75054 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.45
IGSF3O75054 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.45
IGSF3O75054 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
IGSF3O75054 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
IGSF3O75054 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
IGSF3O75054 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
IGSF3O75054 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
IGSF3O75054 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
IGSF3O75054 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
IGSF3O75054 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
IGSF3O75054 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
IGSF3O75054 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
IGSF3O75054 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
IGSF3O75054 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
IGSF3O75054 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
IGSF3O75054 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
IGSF3O75054 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
IGSF3O75054 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
IGSF3O75054 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
IGSF3O75054 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
IGSF3O75054 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
IGSF3O75054 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
IGSF3O75054 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
IGSF3O75054 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
IGSF3O75054 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
IGSF3O75054 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
IGSF3O75054 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
IGSF3O75054 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
IGSF3O75054 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
IGSF3O75054 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
IGSF3O75054 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
IGSF3O75054 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
IGSF3O75054 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
IGSF3O75054 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
IGSF3O75054 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
IGSF3O75054 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
IGSF3O75054 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
IGSF3O75054 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
IGSF3O75054 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
IGSF3O75054 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
IGSF3O75054 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
IGSF3O75054 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
IGSF3O75054 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
IGSF3O75054 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
IGSF3O75054 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
IGSF3O75054 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
IGSF3O75054 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
IGSF3O75054 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
IGSF3O75054 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
IGSF3O75054 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
IGSF3O75054 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
IGSF3O75054 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
IGSF3O75054 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
IGSF3O75054 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
IGSF3O75054 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
IGSF3O75054 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
IGSF3O75054 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
IGSF3O75054 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
IGSF3O75054 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
IGSF3O75054 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
IGSF3O75054 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
IGSF3O75054 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
IGSF3O75054 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
IGSF3O75054 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
IGSF3O75054 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
IGSF3O75054 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
IGSF3O75054 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms