Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF208O43345 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF208O43345 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF208O43345 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF208O43345 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF208O43345 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF208O43345 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF208O43345 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF208O43345 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF208O43345 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF208O43345 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF208O43345 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF208O43345 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF208O43345 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF208O43345 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF208O43345 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF208O43345 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF208O43345 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF208O43345 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF208O43345 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF208O43345 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF208O43345 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF208O43345 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF208O43345 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF208O43345 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF208O43345 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF208O43345 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF208O43345 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF208O43345 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF208O43345 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF208O43345 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF208O43345 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF208O43345 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF208O43345 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF208O43345 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF208O43345 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF208O43345 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF208O43345 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF208O43345 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF208O43345 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF208O43345 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF208O43345 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF208O43345 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF208O43345 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF208O43345 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF208O43345 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF208O43345 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF208O43345 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF208O43345 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF208O43345 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF208O43345 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF208O43345 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF208O43345 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF208O43345 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF208O43345 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF208O43345 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF208O43345 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF208O43345 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF208O43345 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF208O43345 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF208O43345 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF208O43345 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF208O43345 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF208O43345 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF208O43345 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF208O43345 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF208O43345 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF208O43345 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF208O43345 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF208O43345 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF208O43345 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF208O43345 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF208O43345 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF208O43345 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF208O43345 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF208O43345 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF208O43345 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF208O43345 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF208O43345 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF208O43345 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF208O43345 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF208O43345 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF208O43345 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF208O43345 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF208O43345 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF208O43345 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF208O43345 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF208O43345 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF208O43345 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF208O43345 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF208O43345 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF208O43345 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF208O43345 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF208O43345 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF208O43345 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF208O43345 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF208O43345 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF208O43345 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF208O43345 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF208O43345 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms