Protein–RNA interactions for Protein: O00327

ARNTL, Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARNTLO00327 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ARNTLO00327 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARNTLO00327 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ARNTLO00327 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ARNTLO00327 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARNTLO00327 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARNTLO00327 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARNTLO00327 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARNTLO00327 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARNTLO00327 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARNTLO00327 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARNTLO00327 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARNTLO00327 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARNTLO00327 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARNTLO00327 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARNTLO00327 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARNTLO00327 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARNTLO00327 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ARNTLO00327 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARNTLO00327 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARNTLO00327 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARNTLO00327 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARNTLO00327 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ARNTLO00327 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ARNTLO00327 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ARNTLO00327 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ARNTLO00327 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARNTLO00327 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARNTLO00327 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARNTLO00327 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARNTLO00327 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARNTLO00327 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARNTLO00327 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARNTLO00327 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ARNTLO00327 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARNTLO00327 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARNTLO00327 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARNTLO00327 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ARNTLO00327 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARNTLO00327 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARNTLO00327 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARNTLO00327 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARNTLO00327 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARNTLO00327 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARNTLO00327 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARNTLO00327 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARNTLO00327 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARNTLO00327 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARNTLO00327 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARNTLO00327 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARNTLO00327 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARNTLO00327 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARNTLO00327 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARNTLO00327 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARNTLO00327 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARNTLO00327 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARNTLO00327 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARNTLO00327 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARNTLO00327 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARNTLO00327 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARNTLO00327 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARNTLO00327 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARNTLO00327 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ARNTLO00327 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ARNTLO00327 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARNTLO00327 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ARNTLO00327 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ARNTLO00327 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARNTLO00327 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ARNTLO00327 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARNTLO00327 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARNTLO00327 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARNTLO00327 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARNTLO00327 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARNTLO00327 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARNTLO00327 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARNTLO00327 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARNTLO00327 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARNTLO00327 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ARNTLO00327 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARNTLO00327 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARNTLO00327 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARNTLO00327 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARNTLO00327 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARNTLO00327 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARNTLO00327 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARNTLO00327 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARNTLO00327 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARNTLO00327 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARNTLO00327 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARNTLO00327 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARNTLO00327 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ARNTLO00327 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARNTLO00327 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARNTLO00327 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARNTLO00327 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARNTLO00327 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ARNTLO00327 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARNTLO00327 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARNTLO00327 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms