Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DFFAO00273 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DFFAO00273 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DFFAO00273 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DFFAO00273 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DFFAO00273 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DFFAO00273 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DFFAO00273 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DFFAO00273 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DFFAO00273 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
DFFAO00273 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
DFFAO00273 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DFFAO00273 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DFFAO00273 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DFFAO00273 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DFFAO00273 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DFFAO00273 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
DFFAO00273 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DFFAO00273 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DFFAO00273 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DFFAO00273 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DFFAO00273 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DFFAO00273 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DFFAO00273 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
DFFAO00273 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DFFAO00273 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DFFAO00273 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DFFAO00273 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
DFFAO00273 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DFFAO00273 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DFFAO00273 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
DFFAO00273 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DFFAO00273 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DFFAO00273 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DFFAO00273 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DFFAO00273 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
DFFAO00273 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
DFFAO00273 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DFFAO00273 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DFFAO00273 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DFFAO00273 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DFFAO00273 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DFFAO00273 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DFFAO00273 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DFFAO00273 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DFFAO00273 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DFFAO00273 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DFFAO00273 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DFFAO00273 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DFFAO00273 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DFFAO00273 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DFFAO00273 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DFFAO00273 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DFFAO00273 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DFFAO00273 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DFFAO00273 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DFFAO00273 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DFFAO00273 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DFFAO00273 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
DFFAO00273 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DFFAO00273 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DFFAO00273 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DFFAO00273 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DFFAO00273 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DFFAO00273 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DFFAO00273 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DFFAO00273 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DFFAO00273 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DFFAO00273 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
DFFAO00273 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DFFAO00273 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DFFAO00273 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DFFAO00273 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DFFAO00273 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DFFAO00273 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DFFAO00273 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DFFAO00273 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DFFAO00273 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DFFAO00273 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DFFAO00273 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DFFAO00273 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DFFAO00273 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DFFAO00273 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DFFAO00273 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DFFAO00273 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DFFAO00273 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DFFAO00273 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DFFAO00273 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DFFAO00273 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DFFAO00273 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DFFAO00273 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
DFFAO00273 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DFFAO00273 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DFFAO00273 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DFFAO00273 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DFFAO00273 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DFFAO00273 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
DFFAO00273 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DFFAO00273 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DFFAO00273 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms