Protein–RNA interactions for Protein: H7C0S8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0S8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
H7C0S8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
H7C0S8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
H7C0S8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
H7C0S8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
H7C0S8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
H7C0S8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
H7C0S8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
H7C0S8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
H7C0S8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
H7C0S8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H7C0S8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H7C0S8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
H7C0S8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
H7C0S8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
H7C0S8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
H7C0S8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
H7C0S8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H7C0S8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
H7C0S8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
H7C0S8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
H7C0S8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
H7C0S8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
H7C0S8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
H7C0S8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
H7C0S8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
H7C0S8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
H7C0S8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
H7C0S8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
H7C0S8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
H7C0S8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
H7C0S8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
H7C0S8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
H7C0S8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
H7C0S8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
H7C0S8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
H7C0S8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
H7C0S8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
H7C0S8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
H7C0S8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
H7C0S8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
H7C0S8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
H7C0S8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
H7C0S8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
H7C0S8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
H7C0S8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
H7C0S8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
H7C0S8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
H7C0S8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
H7C0S8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
H7C0S8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
H7C0S8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
H7C0S8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
H7C0S8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
H7C0S8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
H7C0S8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
H7C0S8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
H7C0S8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
H7C0S8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
H7C0S8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
H7C0S8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
H7C0S8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
H7C0S8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
H7C0S8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H7C0S8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H7C0S8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H7C0S8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
H7C0S8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
H7C0S8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
H7C0S8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
H7C0S8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
H7C0S8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
H7C0S8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
H7C0S8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
H7C0S8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
H7C0S8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
H7C0S8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
H7C0S8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
H7C0S8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
H7C0S8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
H7C0S8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
H7C0S8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
H7C0S8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
H7C0S8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
H7C0S8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
H7C0S8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
H7C0S8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
H7C0S8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
H7C0S8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
H7C0S8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
H7C0S8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
H7C0S8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
H7C0S8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H7C0S8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H7C0S8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
H7C0S8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
H7C0S8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
H7C0S8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
H7C0S8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
H7C0S8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms