Protein–RNA interactions for Protein: A6NDA9

LRIT2, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT2A6NDA9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LRIT2A6NDA9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LRIT2A6NDA9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRIT2A6NDA9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRIT2A6NDA9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRIT2A6NDA9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRIT2A6NDA9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRIT2A6NDA9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRIT2A6NDA9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRIT2A6NDA9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRIT2A6NDA9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRIT2A6NDA9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRIT2A6NDA9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRIT2A6NDA9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRIT2A6NDA9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRIT2A6NDA9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRIT2A6NDA9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRIT2A6NDA9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRIT2A6NDA9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRIT2A6NDA9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRIT2A6NDA9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRIT2A6NDA9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
LRIT2A6NDA9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRIT2A6NDA9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRIT2A6NDA9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRIT2A6NDA9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LRIT2A6NDA9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRIT2A6NDA9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LRIT2A6NDA9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRIT2A6NDA9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRIT2A6NDA9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRIT2A6NDA9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRIT2A6NDA9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRIT2A6NDA9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRIT2A6NDA9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRIT2A6NDA9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRIT2A6NDA9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LRIT2A6NDA9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LRIT2A6NDA9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRIT2A6NDA9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRIT2A6NDA9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRIT2A6NDA9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRIT2A6NDA9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRIT2A6NDA9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRIT2A6NDA9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRIT2A6NDA9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRIT2A6NDA9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRIT2A6NDA9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRIT2A6NDA9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRIT2A6NDA9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRIT2A6NDA9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRIT2A6NDA9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRIT2A6NDA9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRIT2A6NDA9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRIT2A6NDA9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRIT2A6NDA9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRIT2A6NDA9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRIT2A6NDA9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRIT2A6NDA9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRIT2A6NDA9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRIT2A6NDA9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRIT2A6NDA9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LRIT2A6NDA9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRIT2A6NDA9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRIT2A6NDA9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRIT2A6NDA9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRIT2A6NDA9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRIT2A6NDA9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRIT2A6NDA9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRIT2A6NDA9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LRIT2A6NDA9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRIT2A6NDA9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRIT2A6NDA9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRIT2A6NDA9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRIT2A6NDA9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRIT2A6NDA9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRIT2A6NDA9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRIT2A6NDA9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRIT2A6NDA9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRIT2A6NDA9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LRIT2A6NDA9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRIT2A6NDA9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LRIT2A6NDA9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRIT2A6NDA9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRIT2A6NDA9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRIT2A6NDA9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRIT2A6NDA9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRIT2A6NDA9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRIT2A6NDA9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRIT2A6NDA9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRIT2A6NDA9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRIT2A6NDA9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LRIT2A6NDA9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LRIT2A6NDA9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRIT2A6NDA9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRIT2A6NDA9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRIT2A6NDA9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRIT2A6NDA9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRIT2A6NDA9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRIT2A6NDA9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms