RNA–Protein interactions for RNA: YKL061W

BLI1, Transcript of Subunit of the BLOC-1 complex involved in endosomal maturation, yeast

Gene BLI1, Length 342 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BLI1	YKL061W	KIC1	P38692	1080 aa		6.33	□□□□□ -1.4
BLI1	YKL061W	TFB4	Q12004	338 aa		6.33	□□□□□ -1.4
BLI1	YKL061W	SEC2	P17065	759 aa		6.32	□□□□□ -1.4
BLI1	YKL061W	FRK1	Q03002	865 aa	Predicted RBP	6.32	□□□□□ -1.4
BLI1	YKL061W	CSC1	Q06538	782 aa		6.32	□□□□□ -1.4
BLI1	YKL061W	GCD11	P32481	527 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
BLI1	YKL061W	SPT16	P32558	1035 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
BLI1	YKL061W	NPL4	P33755	580 aa		6.29	□□□□□ -1.4
BLI1	YKL061W	ORC6	P38826	435 aa		6.28	□□□□□ -1.4
BLI1	YKL061W	CDC4	P07834	779 aa		6.27	□□□□□ -1.41
BLI1	YKL061W	MET22	P32179	357 aa		6.27	□□□□□ -1.41
BLI1	YKL061W	BDP1	P46678	594 aa		6.27	□□□□□ -1.41
BLI1	YKL061W	RRN7	P40992	514 aa		6.25	□□□□□ -1.41
BLI1	YKL061W	ENV9	Q08651	330 aa		6.22	□□□□□ -1.41
BLI1	YKL061W	REF2	P42073	533 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
BLI1	YKL061W	MVP1	P40959	511 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
BLI1	YKL061W	IFH1	P39520	1085 aa		6.19	□□□□□ -1.42
BLI1	YKL061W	HED1	Q03937	162 aa		6.18	□□□□□ -1.42
BLI1	YKL061W	YPR109W	Q06104	294 aa		6.18	□□□□□ -1.42
BLI1	YKL061W	ERF2	Q06551	359 aa		6.18	□□□□□ -1.42
BLI1	YKL061W	YDR444W	Q04093	687 aa		6.17	□□□□□ -1.42
BLI1	YKL061W	KEX2	P13134	814 aa		6.15	□□□□□ -1.42
BLI1	YKL061W	YPR148C	Q06523	435 aa		6.15	□□□□□ -1.42
BLI1	YKL061W	MET32	Q12041	191 aa		6.15	□□□□□ -1.42
BLI1	YKL061W	RGR1	P19263	1082 aa		6.14	□□□□□ -1.43
BLI1	YKL061W	PAT1	P25644	796 aa	Known RBP	6.14	□□□□□ -1.43
BLI1	YKL061W	YDL176W	Q12027	708 aa		6.14	□□□□□ -1.43
BLI1	YKL061W	ASH1	P34233	588 aa		6.13	□□□□□ -1.43
BLI1	YKL061W	COX6	P00427	148 aa		6.11	□□□□□ -1.43
BLI1	YKL061W	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
BLI1	YKL061W	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
BLI1	YKL061W	MOD5	P07884	428 aa		6.09	□□□□□ -1.43
BLI1	YKL061W	PUS5	Q06244	254 aa		6.09	□□□□□ -1.43
BLI1	YKL061W	AFT1	P22149	690 aa		6.07	□□□□□ -1.44
BLI1	YKL061W	VPS70	P47161	811 aa		6.07	□□□□□ -1.44
BLI1	YKL061W	HST3	P53687	447 aa		6.06	□□□□□ -1.44
BLI1	YKL061W	MAK21	Q12176	1025 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
BLI1	YKL061W	RRD1	P40454	393 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
BLI1	YKL061W	AGE1	Q04412	482 aa		6.05	□□□□□ -1.44
BLI1	YKL061W	YJR115W	P47152	169 aa		6.03	□□□□□ -1.44
BLI1	YKL061W	TUB4	P53378	473 aa		6.03	□□□□□ -1.44
BLI1	YKL061W	CAF120	P53836	1060 aa		5.96	□□□□□ -1.46
BLI1	YKL061W	PSE1	P32337	1089 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
BLI1	YKL061W	YNL115C	P53925	644 aa		5.91	□□□□□ -1.46
BLI1	YKL061W	ACO2	P39533	789 aa		5.9	□□□□□ -1.46
BLI1	YKL061W	MSB3	P48566	633 aa	Predicted RBP	5.9	□□□□□ -1.46
BLI1	YKL061W	RTF1	P53064	558 aa		5.9	□□□□□ -1.46
BLI1	YKL061W	OPT2	Q06593	877 aa		5.89	□□□□□ -1.47
BLI1	YKL061W	MTC5	Q03897	1148 aa		5.88	□□□□□ -1.47
BLI1	YKL061W	CLB5	P30283	435 aa		5.87	□□□□□ -1.47
BLI1	YKL061W	TPD3	P31383	635 aa		5.87	□□□□□ -1.47
BLI1	YKL061W	HXT10	P43581	546 aa		5.87	□□□□□ -1.47
BLI1	YKL061W	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
BLI1	YKL061W	KXD1	P53158	218 aa		5.87	□□□□□ -1.47
BLI1	YKL061W	PDC1	P06169	563 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
BLI1	YKL061W	PBS2	P08018	668 aa		5.86	□□□□□ -1.47
BLI1	YKL061W	UGA3	P26370	528 aa		5.86	□□□□□ -1.47
BLI1	YKL061W	SYH1	Q02875	849 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
BLI1	YKL061W	SIT4	P20604	311 aa		5.85	□□□□□ -1.47
BLI1	YKL061W	TRK2	P28584	889 aa		5.84	□□□□□ -1.47
BLI1	YKL061W	YIR007W	P40566	764 aa		5.83	□□□□□ -1.48
BLI1	YKL061W	YGR035C	P53222	116 aa		5.83	□□□□□ -1.48
BLI1	YKL061W	NIS1	P53939	407 aa		5.82	□□□□□ -1.48
BLI1	YKL061W	SRF1	Q12516	437 aa		5.82	□□□□□ -1.48
BLI1	YKL061W	HPF1	Q05164	967 aa		5.8	□□□□□ -1.48
BLI1	YKL061W	YLR346C	Q06139	101 aa		5.8	□□□□□ -1.48
BLI1	YKL061W	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
BLI1	YKL061W	KIP2	P28743	706 aa		5.78	□□□□□ -1.48
BLI1	YKL061W	TEA1	P47988	759 aa		5.78	□□□□□ -1.48
BLI1	YKL061W	TYW1	Q08960	810 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
BLI1	YKL061W	MAM3	Q12296	706 aa		5.78	□□□□□ -1.48
BLI1	YKL061W	SLY41	P22215	453 aa		5.77	□□□□□ -1.49
BLI1	YKL061W	NUP85	P46673	744 aa		5.77	□□□□□ -1.49
BLI1	YKL061W	TY1A-BL	Q12266	440 aa		5.77	□□□□□ -1.49
BLI1	YKL061W	IES2	P40154	320 aa		5.76	□□□□□ -1.49
BLI1	YKL061W	SCW11	P53189	542 aa		5.76	□□□□□ -1.49
BLI1	YKL061W	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
BLI1	YKL061W	IXR1	P33417	597 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BLI1	YKL061W	CKB1	P43639	278 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BLI1	YKL061W	YDL206W	Q12424	762 aa		5.75	□□□□□ -1.49
BLI1	YKL061W	MIP1	P15801	1254 aa		5.74	□□□□□ -1.49
BLI1	YKL061W	RPA14	P50106	137 aa		5.73	□□□□□ -1.49
BLI1	YKL061W	FPK1	P53739	893 aa		5.73	□□□□□ -1.49
BLI1	YKL061W	ALR1	Q08269	859 aa		5.73	□□□□□ -1.49
BLI1	YKL061W	NUP42	P49686	430 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
BLI1	YKL061W	YPR097W	Q06839	1073 aa		5.72	□□□□□ -1.49
BLI1	YKL061W	PUS6	P53294	404 aa		5.7	□□□□□ -1.5
BLI1	YKL061W	TBF1	Q02457	562 aa		5.7	□□□□□ -1.5
BLI1	YKL061W	SCJ1	P25303	377 aa		5.69	□□□□□ -1.5
BLI1	YKL061W	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
BLI1	YKL061W	DSF2	P38213	736 aa		5.68	□□□□□ -1.5
BLI1	YKL061W	YMR196W	Q04336	1088 aa		5.68	□□□□□ -1.5
BLI1	YKL061W	AAD14	P42884	376 aa		5.67	□□□□□ -1.5
BLI1	YKL061W	DIT2	P21595	489 aa		5.66	□□□□□ -1.5
BLI1	YKL061W	LSC2	P53312	427 aa		5.66	□□□□□ -1.5
BLI1	YKL061W	DLD1	P32891	587 aa		5.65	□□□□□ -1.5
BLI1	YKL061W	ITT1	Q04638	464 aa		5.65	□□□□□ -1.5
BLI1	YKL061W	ARG82	P07250	355 aa		5.64	□□□□□ -1.51
BLI1	YKL061W	ICP55	P40051	511 aa		5.64	□□□□□ -1.51
BLI1	YKL061W	YJR098C	P47139	656 aa		5.64	□□□□□ -1.51

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