Protein–RNA interactions for Protein: P33755

NPL4, Nuclear protein localization protein 4, yeastyeast

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NPL4P33755 YML009W-BYML009W-B 477 nt24.3■■□□□ 1.48
NPL4P33755 NSR1YGR159C 1245 nt23.9■■□□□ 1.42
NPL4P33755 NOP1YDL014W 984 nt23.67■■□□□ 1.38
NPL4P33755 YKL036CYKL036C 393 nt21.95■■□□□ 1.1
NPL4P33755 MDJ1YFL016C 1536 nt21.11■□□□□ 0.97
NPL4P33755 Q0297Q0297 156 nt20.65■□□□□ 0.9
NPL4P33755 SRX1YKL086W 384 nt20.6■□□□□ 0.89
NPL4P33755 YJL027CYJL027C 417 nt20.59■□□□□ 0.89
NPL4P33755 SCS3YGL126W 1143 nt20.01■□□□□ 0.79
NPL4P33755 YCR051WYCR051W 669 nt19.7■□□□□ 0.74
NPL4P33755 YOL085CYOL085C 342 nt18.98■□□□□ 0.63
NPL4P33755 PKP1YIL042C 1185 nt18.77■□□□□ 0.6
NPL4P33755 DBP2YNL112W 1641 nt18.61■□□□□ 0.57
NPL4P33755 RPP1BYDL130W 321 nt18.58■□□□□ 0.56
NPL4P33755 CCC1YLR220W 969 nt18.51■□□□□ 0.55
NPL4P33755 TRN1tP(UGG)A 72 nt18.49■□□□□ 0.55
NPL4P33755 SUF9tP(UGG)F 72 nt18.49■□□□□ 0.55
NPL4P33755 SUF8tP(UGG)H 72 nt18.49■□□□□ 0.55
NPL4P33755 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt18.49■□□□□ 0.55
NPL4P33755 SUF7tP(UGG)M 72 nt18.49■□□□□ 0.55
NPL4P33755 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt18.49■□□□□ 0.55
NPL4P33755 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt18.49■□□□□ 0.55
NPL4P33755 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt18.49■□□□□ 0.55
NPL4P33755 SUF11tP(UGG)O2 72 nt18.49■□□□□ 0.55
NPL4P33755 ATS1YAL020C 1002 nt17.96■□□□□ 0.47
NPL4P33755 YBR190WYBR190W 312 nt17.92■□□□□ 0.46
NPL4P33755 SCJ1YMR214W 1134 nt17.87■□□□□ 0.45
NPL4P33755 PET122YER153C 765 nt17.74■□□□□ 0.43
NPL4P33755 RVS167YDR388W 1449 nt17.72■□□□□ 0.43
NPL4P33755 RTC3YHR087W 336 nt17.7■□□□□ 0.42
NPL4P33755 SCR1SCR1 522 nt17.68■□□□□ 0.42
NPL4P33755 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt17.61■□□□□ 0.41
NPL4P33755 RRN5YLR141W 1092 nt17.29■□□□□ 0.36
NPL4P33755 SHR5YOL110W 714 nt17.07■□□□□ 0.32
NPL4P33755 RSB1YOR049C 1065 nt17.04■□□□□ 0.32
NPL4P33755 YDJ1YNL064C 1230 nt16.98■□□□□ 0.31
NPL4P33755 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.91■□□□□ 0.3
NPL4P33755 GAR1YHR089C 618 nt16.71■□□□□ 0.27
NPL4P33755 DEP1YAL013W 1218 nt16.64■□□□□ 0.25
NPL4P33755 PST2YDR032C 597 nt16.56■□□□□ 0.24
NPL4P33755 URN1YPR152C 1398 nt16.53■□□□□ 0.24
NPL4P33755 RPN10YHR200W 807 nt16.36■□□□□ 0.21
NPL4P33755 YNL208WYNL208W 600 nt16.33■□□□□ 0.2
NPL4P33755 OPI9YLR338W 858 nt16.19■□□□□ 0.18
NPL4P33755 SAH1YER043C 1350 nt16.11■□□□□ 0.17
NPL4P33755 TIR1YER011W 765 nt16.08■□□□□ 0.16
NPL4P33755 YKL097CYKL097C 411 nt16.08■□□□□ 0.16
NPL4P33755 PUT4YOR348C 1884 nt16.07■□□□□ 0.16
NPL4P33755 SHU1YHL006C 453 nt15.88■□□□□ 0.13
NPL4P33755 ARE1YCR048W 1833 nt15.84■□□□□ 0.13
NPL4P33755 SSA1YAL005C 1929 nt15.8■□□□□ 0.12
NPL4P33755 YJR018WYJR018W 363 nt15.78■□□□□ 0.12
NPL4P33755 PUN1YLR414C 792 nt15.77■□□□□ 0.12
NPL4P33755 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.73■□□□□ 0.11
NPL4P33755 POA1YBR022W 534 nt15.72■□□□□ 0.11
NPL4P33755 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt15.68■□□□□ 0.1
NPL4P33755 RPP2BYDR382W 333 nt15.58■□□□□ 0.08
NPL4P33755 PTC2YER089C 1395 nt15.58■□□□□ 0.08
NPL4P33755 SRB2YHR041C 633 nt15.52■□□□□ 0.08
NPL4P33755 BUD23YCR047C 828 nt15.49■□□□□ 0.07
NPL4P33755 WWM1YFL010C 636 nt15.41■□□□□ 0.06
NPL4P33755 YJR120WYJR120W 351 nt15.41■□□□□ 0.06
NPL4P33755 YGR021WYGR021W 873 nt15.36■□□□□ 0.05
NPL4P33755 SSA3YBL075C 1950 nt15.33■□□□□ 0.05
NPL4P33755 YOR139CYOR139C 393 nt15.31■□□□□ 0.04
NPL4P33755 NAB2YGL122C 1578 nt15.31■□□□□ 0.04
NPL4P33755 BSC6YOL137W 1494 nt15.29■□□□□ 0.04
NPL4P33755 FPR4YLR449W 1179 nt15.29■□□□□ 0.04
NPL4P33755 NPL3YDR432W 1245 nt15.28■□□□□ 0.04
NPL4P33755 MNP1YGL068W 585 nt15.26■□□□□ 0.03
NPL4P33755 HOM6YJR139C 1080 nt15.25■□□□□ 0.03
NPL4P33755 INM2YDR287W 879 nt15.2■□□□□ 0.02
NPL4P33755 BDH2YAL061W 1254 nt15.19■□□□□ 0.02
NPL4P33755 DAL1YIR027C 1383 nt15.14■□□□□ 0.01
NPL4P33755 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt15.12■□□□□ 0.01
NPL4P33755 YBL100CYBL100C 315 nt15.09■□□□□ 0.01
NPL4P33755 RKM5YLR137W 1104 nt15.06■□□□□ 0
NPL4P33755 YOL037CYOL037C 354 nt15.04■□□□□ -0
NPL4P33755 FIS1YIL065C 468 nt15.02■□□□□ -0
NPL4P33755 LSM3YLR438C-A 270 nt15.01□□□□□ -0.01
NPL4P33755 PHO4YFR034C 939 nt14.99□□□□□ -0.01
NPL4P33755 TRM9YML014W 840 nt14.97□□□□□ -0.01
NPL4P33755 FUN26YAL022C 1554 nt14.9□□□□□ -0.02
NPL4P33755 YGR139WYGR139W 339 nt14.88□□□□□ -0.03
NPL4P33755 Q0182Q0182 405 nt14.76□□□□□ -0.05
NPL4P33755 ALF1YNL148C 765 nt14.75□□□□□ -0.05
NPL4P33755 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.73□□□□□ -0.05
NPL4P33755 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.73□□□□□ -0.05
NPL4P33755 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.73□□□□□ -0.05
NPL4P33755 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.73□□□□□ -0.05
NPL4P33755 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.73□□□□□ -0.05
NPL4P33755 PUS2YGL063W 1113 nt14.68□□□□□ -0.06
NPL4P33755 YLR281CYLR281C 468 nt14.67□□□□□ -0.06
NPL4P33755 CCT6YDR188W 1641 nt14.66□□□□□ -0.06
NPL4P33755 WHI5YOR083W 888 nt14.65□□□□□ -0.06
NPL4P33755 SUF2tP(AGG)C 72 nt14.63□□□□□ -0.07
NPL4P33755 SUF10tP(AGG)N 72 nt14.63□□□□□ -0.07
NPL4P33755 MOT3YMR070W 1473 nt14.63□□□□□ -0.07
NPL4P33755 YPS1YLR120C 1710 nt14.58□□□□□ -0.07
NPL4P33755 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt14.56□□□□□ -0.08
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