RNA–Protein interactions for RNA: Q0144

Q0144, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene Q0144, Length 330 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
Q0144Q0144 TY1A-JR2P47099 440 aa12□□□□□ -0.49
Q0144Q0144 TY1A-DR1Q03856 440 aa12□□□□□ -0.49
Q0144Q0144 TY1A-ML1Q04706 440 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
Q0144Q0144 TY1A-BRQ12217 440 aa12□□□□□ -0.49
Q0144Q0144 TY1A-NL2Q12470 440 aa12□□□□□ -0.49
Q0144Q0144 TY1A-GR2Q12485 440 aa12□□□□□ -0.49
Q0144Q0144 PBS2P08018 668 aa11.98□□□□□ -0.49
Q0144Q0144 SEC2P17065 759 aa11.97□□□□□ -0.49
Q0144Q0144 RGA2Q06407 1009 aa11.94□□□□□ -0.5
Q0144Q0144 CST6P40535 587 aa11.93□□□□□ -0.5
Q0144Q0144 PAT1P25644 796 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
Q0144Q0144 PSE1P32337 1089 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
Q0144Q0144 RRN7P40992 514 aa11.9□□□□□ -0.5
Q0144Q0144 LAM6Q08001 693 aa11.89□□□□□ -0.51
Q0144Q0144 MAM3Q12296 706 aa11.86□□□□□ -0.51
Q0144Q0144 CLB5P30283 435 aa11.84□□□□□ -0.51
Q0144Q0144 RGA1P39083 1007 aa11.84□□□□□ -0.51
Q0144Q0144 KEX2P13134 814 aa11.83□□□□□ -0.52
Q0144Q0144 AIR1P40507 360 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
Q0144Q0144 FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
Q0144Q0144 CLA4P48562 842 aa11.81□□□□□ -0.52
Q0144Q0144 BRE2P43132 505 aa11.79□□□□□ -0.52
Q0144Q0144 BDP1P46678 594 aa11.79□□□□□ -0.52
Q0144Q0144 ERF2Q06551 359 aa11.79□□□□□ -0.52
Q0144Q0144 SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
Q0144Q0144 DSF2P38213 736 aa11.77□□□□□ -0.53
Q0144Q0144 DMA1P38823 416 aa11.77□□□□□ -0.53
Q0144Q0144 GCR2Q01722 534 aa11.77□□□□□ -0.53
Q0144Q0144 IES2P40154 320 aa11.75□□□□□ -0.53
Q0144Q0144 CDC4P07834 779 aa11.73□□□□□ -0.53
Q0144Q0144 RTF1P53064 558 aa11.7□□□□□ -0.54
Q0144Q0144 HED1Q03937 162 aa11.7□□□□□ -0.54
Q0144Q0144 PAC1P39946 494 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
Q0144Q0144 TEA1P47988 759 aa11.65□□□□□ -0.54
Q0144Q0144 NUP42P49686 430 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
Q0144Q0144 TUB4P53378 473 aa11.65□□□□□ -0.54
Q0144Q0144 AGE1Q04412 482 aa11.65□□□□□ -0.54
Q0144Q0144 YNL115CP53925 644 aa11.64□□□□□ -0.55
Q0144Q0144 MOD5P07884 428 aa11.62□□□□□ -0.55
Q0144Q0144 SPB4P25808 606 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
Q0144Q0144 SIT4P20604 311 aa11.6□□□□□ -0.55
Q0144Q0144 YPL062WQ02781 134 aa11.57□□□□□ -0.56
Q0144Q0144 GAR1P28007 205 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
Q0144Q0144 NIS1P53939 407 aa11.55□□□□□ -0.56
Q0144Q0144 DIT2P21595 489 aa11.53□□□□□ -0.56
Q0144Q0144 GBP2P25555 427 aaKnown RBP RIP-Chip data11.53□□□□□ -0.56not detected
Q0144Q0144 PUS5Q06244 254 aa11.52□□□□□ -0.57
Q0144Q0144 KXD1P53158 218 aa11.51□□□□□ -0.57
Q0144Q0144 MET32Q12041 191 aa11.5□□□□□ -0.57
Q0144Q0144 ASH1P34233 588 aa11.48□□□□□ -0.57
Q0144Q0144 AFT1P22149 690 aa11.47□□□□□ -0.57
Q0144Q0144 HST3P53687 447 aa11.47□□□□□ -0.57
Q0144Q0144 YMR196WQ04336 1088 aa11.47□□□□□ -0.57
Q0144Q0144 MET22P32179 357 aa11.46□□□□□ -0.57
Q0144Q0144 TPD3P31383 635 aa11.45□□□□□ -0.58
Q0144Q0144 FPK1P53739 893 aa11.45□□□□□ -0.58
Q0144Q0144 ENV9Q08651 330 aa11.45□□□□□ -0.58
Q0144Q0144 SLY41P22215 453 aa11.44□□□□□ -0.58
Q0144Q0144 RRD1P40454 393 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
Q0144Q0144 HXT10P43581 546 aa11.42□□□□□ -0.58
Q0144Q0144 PDC1P06169 563 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
Q0144Q0144 YDR444WQ04093 687 aa11.38□□□□□ -0.59
Q0144Q0144 SYH1Q02875 849 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
Q0144Q0144 TBF1Q02457 562 aa11.36□□□□□ -0.59
Q0144Q0144 PUS6P53294 404 aa11.34□□□□□ -0.59
Q0144Q0144 RPA14P50106 137 aa11.33□□□□□ -0.6
Q0144Q0144 ALR1Q08269 859 aa11.33□□□□□ -0.6
Q0144Q0144 HST2P53686 357 aa11.32□□□□□ -0.6
Q0144Q0144 LCB5Q06147 687 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
Q0144Q0144 YDL206WQ12424 762 aa11.31□□□□□ -0.6
Q0144Q0144 YJR115WP47152 169 aa11.3□□□□□ -0.6
Q0144Q0144 ATF2P53296 535 aa11.3□□□□□ -0.6
Q0144Q0144 MSB3P48566 633 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
Q0144Q0144 YPR097WQ06839 1073 aa11.28□□□□□ -0.6
Q0144Q0144 SCJ1P25303 377 aa11.27□□□□□ -0.61
Q0144Q0144 BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data11.27□□□□□ -0.61not detected
Q0144Q0144 MMP1Q12372 583 aa11.27□□□□□ -0.61
Q0144Q0144 TRM1P15565 570 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
Q0144Q0144 KIP2P28743 706 aa11.26□□□□□ -0.61
Q0144Q0144 GLN1P32288 370 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
Q0144Q0144 YNR021WP53723 404 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
Q0144Q0144 UGA3P26370 528 aa11.21□□□□□ -0.61
Q0144Q0144 IXR1P33417 597 aa11.2□□□□□ -0.62
Q0144Q0144 GLC3P32775 704 aa11.17□□□□□ -0.62
Q0144Q0144 ESS1P22696 170 aa11.16□□□□□ -0.62
Q0144Q0144 YDL176WQ12027 708 aa11.16□□□□□ -0.62
Q0144Q0144 SRF1Q12516 437 aa11.16□□□□□ -0.62
Q0144Q0144 MRT4P33201 236 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
Q0144Q0144 PTK2P47116 818 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
Q0144Q0144 RTT106P40161 455 aa11.13□□□□□ -0.63
Q0144Q0144 YJU3P28321 313 aa11.09□□□□□ -0.63
Q0144Q0144 YLR346CQ06139 101 aa11.09□□□□□ -0.63
Q0144Q0144 TYW1Q08960 810 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
Q0144Q0144 VAC17P25591 423 aa11.06□□□□□ -0.64
Q0144Q0144 AIM7Q12156 149 aa11.06□□□□□ -0.64
Q0144Q0144 OPT2Q06593 877 aa11.05□□□□□ -0.64
Q0144Q0144 RSC30P38781 883 aa11.03□□□□□ -0.64
Q0144Q0144 NUP85P46673 744 aa11.03□□□□□ -0.64
Q0144Q0144 PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
Q0144Q0144 CAF120P53836 1060 aa11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 39.4 ms