Protein–RNA interactions for Protein: Q06407

RGA2, Rho-type GTPase-activating protein 2, yeastyeast

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Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RGA2Q06407 YML009W-BYML009W-B 477 nt22■■□□□ 1.11
RGA2Q06407 NSR1YGR159C 1245 nt21.89■■□□□ 1.09
RGA2Q06407 NOP1YDL014W 984 nt21.4■■□□□ 1.02
RGA2Q06407 YKL036CYKL036C 393 nt19.78■□□□□ 0.76
RGA2Q06407 MDJ1YFL016C 1536 nt19.4■□□□□ 0.7
RGA2Q06407 Q0297Q0297 156 nt18.78■□□□□ 0.6
RGA2Q06407 SRX1YKL086W 384 nt18.73■□□□□ 0.59
RGA2Q06407 YJL027CYJL027C 417 nt18.45■□□□□ 0.54
RGA2Q06407 SCS3YGL126W 1143 nt18.01■□□□□ 0.47
RGA2Q06407 YCR051WYCR051W 669 nt17.74■□□□□ 0.43
RGA2Q06407 DBP2YNL112W 1641 nt17.21■□□□□ 0.35
RGA2Q06407 YOL085CYOL085C 342 nt17.14■□□□□ 0.33
RGA2Q06407 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.92■□□□□ 0.3
RGA2Q06407 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.92■□□□□ 0.3
RGA2Q06407 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.92■□□□□ 0.3
RGA2Q06407 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.92■□□□□ 0.3
RGA2Q06407 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.92■□□□□ 0.3
RGA2Q06407 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.92■□□□□ 0.3
RGA2Q06407 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.92■□□□□ 0.3
RGA2Q06407 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.92■□□□□ 0.3
RGA2Q06407 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.92■□□□□ 0.3
RGA2Q06407 PKP1YIL042C 1185 nt16.86■□□□□ 0.29
RGA2Q06407 RPP1BYDL130W 321 nt16.84■□□□□ 0.29
RGA2Q06407 CCC1YLR220W 969 nt16.72■□□□□ 0.27
RGA2Q06407 YBR190WYBR190W 312 nt16.55■□□□□ 0.24
RGA2Q06407 RTC3YHR087W 336 nt16.15■□□□□ 0.18
RGA2Q06407 RVS167YDR388W 1449 nt16.12■□□□□ 0.17
RGA2Q06407 ATS1YAL020C 1002 nt16.12■□□□□ 0.17
RGA2Q06407 SCJ1YMR214W 1134 nt16.09■□□□□ 0.17
RGA2Q06407 PET122YER153C 765 nt16.08■□□□□ 0.16
RGA2Q06407 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.01■□□□□ 0.15
RGA2Q06407 SCR1SCR1 522 nt15.89■□□□□ 0.13
RGA2Q06407 RRN5YLR141W 1092 nt15.62■□□□□ 0.09
RGA2Q06407 SHR5YOL110W 714 nt15.6■□□□□ 0.09
RGA2Q06407 YDJ1YNL064C 1230 nt15.5■□□□□ 0.07
RGA2Q06407 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.32■□□□□ 0.04
RGA2Q06407 RSB1YOR049C 1065 nt15.28■□□□□ 0.04
RGA2Q06407 URN1YPR152C 1398 nt15.14■□□□□ 0.01
RGA2Q06407 DEP1YAL013W 1218 nt15.14■□□□□ 0.01
RGA2Q06407 GAR1YHR089C 618 nt15.13■□□□□ 0.01
RGA2Q06407 PUT4YOR348C 1884 nt15.03■□□□□ -0
RGA2Q06407 PST2YDR032C 597 nt14.95□□□□□ -0.02
RGA2Q06407 OPI9YLR338W 858 nt14.94□□□□□ -0.02
RGA2Q06407 RPN10YHR200W 807 nt14.91□□□□□ -0.02
RGA2Q06407 YNL208WYNL208W 600 nt14.9□□□□□ -0.02
RGA2Q06407 SSA3YBL075C 1950 nt14.9□□□□□ -0.02
RGA2Q06407 SAH1YER043C 1350 nt14.84□□□□□ -0.03
RGA2Q06407 ARE1YCR048W 1833 nt14.76□□□□□ -0.05
RGA2Q06407 TIR1YER011W 765 nt14.63□□□□□ -0.07
RGA2Q06407 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.55□□□□□ -0.08
RGA2Q06407 POA1YBR022W 534 nt14.54□□□□□ -0.08
RGA2Q06407 VAR1Q0140 1197 nt14.53□□□□□ -0.08
RGA2Q06407 PUN1YLR414C 792 nt14.49□□□□□ -0.09
RGA2Q06407 SSA1YAL005C 1929 nt14.46□□□□□ -0.09
RGA2Q06407 YJR018WYJR018W 363 nt14.45□□□□□ -0.1
RGA2Q06407 SHU1YHL006C 453 nt14.32□□□□□ -0.12
RGA2Q06407 YKL097CYKL097C 411 nt14.32□□□□□ -0.12
RGA2Q06407 PTC2YER089C 1395 nt14.31□□□□□ -0.12
RGA2Q06407 YJR120WYJR120W 351 nt14.28□□□□□ -0.12
RGA2Q06407 SRB2YHR041C 633 nt14.25□□□□□ -0.13
RGA2Q06407 BSC6YOL137W 1494 nt14.23□□□□□ -0.13
RGA2Q06407 BUD23YCR047C 828 nt14.2□□□□□ -0.14
RGA2Q06407 RPP2BYDR382W 333 nt14.14□□□□□ -0.15
RGA2Q06407 NAB2YGL122C 1578 nt14.13□□□□□ -0.15
RGA2Q06407 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.09□□□□□ -0.15
RGA2Q06407 WWM1YFL010C 636 nt13.99□□□□□ -0.17
RGA2Q06407 DAL1YIR027C 1383 nt13.95□□□□□ -0.18
RGA2Q06407 INM2YDR287W 879 nt13.94□□□□□ -0.18
RGA2Q06407 FIS1YIL065C 468 nt13.94□□□□□ -0.18
RGA2Q06407 YGR021WYGR021W 873 nt13.9□□□□□ -0.18
RGA2Q06407 BDH2YAL061W 1254 nt13.89□□□□□ -0.19
RGA2Q06407 HOM6YJR139C 1080 nt13.88□□□□□ -0.19
RGA2Q06407 FPR4YLR449W 1179 nt13.87□□□□□ -0.19
RGA2Q06407 PHO4YFR034C 939 nt13.81□□□□□ -0.2
RGA2Q06407 YBL100CYBL100C 315 nt13.8□□□□□ -0.2
RGA2Q06407 MNP1YGL068W 585 nt13.79□□□□□ -0.2
RGA2Q06407 YOR139CYOR139C 393 nt13.79□□□□□ -0.2
RGA2Q06407 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.76□□□□□ -0.21
RGA2Q06407 LSM3YLR438C-A 270 nt13.73□□□□□ -0.21
RGA2Q06407 Q0017Q0017 162 nt13.67□□□□□ -0.22
RGA2Q06407 RKM5YLR137W 1104 nt13.66□□□□□ -0.22
RGA2Q06407 SPT5YML010W 3192 nt13.65□□□□□ -0.22
RGA2Q06407 FUN26YAL022C 1554 nt13.65□□□□□ -0.22
RGA2Q06407 NPL3YDR432W 1245 nt13.62□□□□□ -0.23
RGA2Q06407 TRM9YML014W 840 nt13.62□□□□□ -0.23
RGA2Q06407 YOL037CYOL037C 354 nt13.57□□□□□ -0.24
RGA2Q06407 YPS1YLR120C 1710 nt13.55□□□□□ -0.24
RGA2Q06407 CCT6YDR188W 1641 nt13.5□□□□□ -0.25
RGA2Q06407 YDR095CYDR095C 411 nt13.47□□□□□ -0.25
RGA2Q06407 ALF1YNL148C 765 nt13.42□□□□□ -0.26
RGA2Q06407 SSA4YER103W 1929 nt13.38□□□□□ -0.27
RGA2Q06407 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.36□□□□□ -0.27
RGA2Q06407 MEP2YNL142W 1500 nt13.35□□□□□ -0.27
RGA2Q06407 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.35□□□□□ -0.27
RGA2Q06407 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.35□□□□□ -0.27
RGA2Q06407 YLR281CYLR281C 468 nt13.28□□□□□ -0.28
RGA2Q06407 SIS1YNL007C 1059 nt13.27□□□□□ -0.29
RGA2Q06407 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.25□□□□□ -0.29
RGA2Q06407 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.25□□□□□ -0.29
RGA2Q06407 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.25□□□□□ -0.29
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