Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SNX8Q9Y5X2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SNX8Q9Y5X2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
SNX8Q9Y5X2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SNX8Q9Y5X2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SNX8Q9Y5X2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SNX8Q9Y5X2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SNX8Q9Y5X2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SNX8Q9Y5X2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SNX8Q9Y5X2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SNX8Q9Y5X2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SNX8Q9Y5X2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SNX8Q9Y5X2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SNX8Q9Y5X2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SNX8Q9Y5X2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SNX8Q9Y5X2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SNX8Q9Y5X2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SNX8Q9Y5X2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SNX8Q9Y5X2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SNX8Q9Y5X2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SNX8Q9Y5X2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SNX8Q9Y5X2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SNX8Q9Y5X2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SNX8Q9Y5X2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SNX8Q9Y5X2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SNX8Q9Y5X2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SNX8Q9Y5X2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SNX8Q9Y5X2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SNX8Q9Y5X2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SNX8Q9Y5X2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SNX8Q9Y5X2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SNX8Q9Y5X2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SNX8Q9Y5X2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SNX8Q9Y5X2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SNX8Q9Y5X2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SNX8Q9Y5X2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SNX8Q9Y5X2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SNX8Q9Y5X2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SNX8Q9Y5X2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNX8Q9Y5X2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SNX8Q9Y5X2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SNX8Q9Y5X2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SNX8Q9Y5X2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SNX8Q9Y5X2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SNX8Q9Y5X2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNX8Q9Y5X2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SNX8Q9Y5X2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SNX8Q9Y5X2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNX8Q9Y5X2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNX8Q9Y5X2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SNX8Q9Y5X2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SNX8Q9Y5X2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNX8Q9Y5X2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNX8Q9Y5X2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SNX8Q9Y5X2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SNX8Q9Y5X2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNX8Q9Y5X2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNX8Q9Y5X2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNX8Q9Y5X2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNX8Q9Y5X2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNX8Q9Y5X2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNX8Q9Y5X2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNX8Q9Y5X2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNX8Q9Y5X2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNX8Q9Y5X2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNX8Q9Y5X2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNX8Q9Y5X2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNX8Q9Y5X2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNX8Q9Y5X2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNX8Q9Y5X2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNX8Q9Y5X2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNX8Q9Y5X2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNX8Q9Y5X2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNX8Q9Y5X2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNX8Q9Y5X2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNX8Q9Y5X2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNX8Q9Y5X2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SNX8Q9Y5X2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SNX8Q9Y5X2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SNX8Q9Y5X2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SNX8Q9Y5X2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNX8Q9Y5X2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SNX8Q9Y5X2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNX8Q9Y5X2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SNX8Q9Y5X2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SNX8Q9Y5X2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNX8Q9Y5X2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNX8Q9Y5X2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SNX8Q9Y5X2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNX8Q9Y5X2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SNX8Q9Y5X2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNX8Q9Y5X2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNX8Q9Y5X2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNX8Q9Y5X2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNX8Q9Y5X2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX8Q9Y5X2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNX8Q9Y5X2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNX8Q9Y5X2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNX8Q9Y5X2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX8Q9Y5X2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms