Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC49.63■■■■■ 5.54
KDM2AQ9Y2K7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.25■■■■■ 5.31
KDM2AQ9Y2K7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC48.15■■■■■ 5.3
KDM2AQ9Y2K7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.11■■■■■ 5.29
KDM2AQ9Y2K7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.01■■■■■ 5.28
KDM2AQ9Y2K7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.98■■■■■ 5.27
KDM2AQ9Y2K7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC47.87■■■■■ 5.25
KDM2AQ9Y2K7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.39■■■■■ 5.18
KDM2AQ9Y2K7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.63■■■■■ 5.06
KDM2AQ9Y2K7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC46.57■■■■■ 5.05
KDM2AQ9Y2K7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.33■■■■■ 5.01
KDM2AQ9Y2K7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC46.33■■■■■ 5.01
KDM2AQ9Y2K7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.27■■■■■ 5
KDM2AQ9Y2K7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC46.26■■■■■ 5
KDM2AQ9Y2K7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC46.08■■■■■ 4.97
KDM2AQ9Y2K7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC45.97■■■■■ 4.95
KDM2AQ9Y2K7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC45.96■■■■■ 4.95
KDM2AQ9Y2K7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.88■■■■■ 4.94
KDM2AQ9Y2K7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
KDM2AQ9Y2K7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.48■■■■■ 4.87
KDM2AQ9Y2K7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
KDM2AQ9Y2K7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC45.38■■■■■ 4.85
KDM2AQ9Y2K7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
KDM2AQ9Y2K7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
KDM2AQ9Y2K7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
KDM2AQ9Y2K7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
KDM2AQ9Y2K7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
KDM2AQ9Y2K7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
KDM2AQ9Y2K7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC44.7■■■■■ 4.75
KDM2AQ9Y2K7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC44.63■■■■■ 4.74
KDM2AQ9Y2K7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
KDM2AQ9Y2K7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
KDM2AQ9Y2K7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.41■■■■■ 4.7
KDM2AQ9Y2K7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
KDM2AQ9Y2K7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC44.29■■■■■ 4.68
KDM2AQ9Y2K7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
KDM2AQ9Y2K7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
KDM2AQ9Y2K7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC43.97■■■■■ 4.63
KDM2AQ9Y2K7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
KDM2AQ9Y2K7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
KDM2AQ9Y2K7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.78■■■■■ 4.6
KDM2AQ9Y2K7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC43.76■■■■■ 4.6
KDM2AQ9Y2K7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
KDM2AQ9Y2K7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC43.72■■■■■ 4.59
KDM2AQ9Y2K7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC43.64■■■■■ 4.58
KDM2AQ9Y2K7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.63■■■■■ 4.57
KDM2AQ9Y2K7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
KDM2AQ9Y2K7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC43.57■■■■■ 4.57
KDM2AQ9Y2K7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.54■■■■■ 4.56
KDM2AQ9Y2K7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC43.47■■■■■ 4.55
KDM2AQ9Y2K7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.38■■■■■ 4.53
KDM2AQ9Y2K7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
KDM2AQ9Y2K7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC43.33■■■■■ 4.53
KDM2AQ9Y2K7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.53
KDM2AQ9Y2K7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.26■■■■■ 4.52
KDM2AQ9Y2K7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC43.15■■■■■ 4.5
KDM2AQ9Y2K7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
KDM2AQ9Y2K7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
KDM2AQ9Y2K7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC43.1■■■■■ 4.49
KDM2AQ9Y2K7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.09■■■■■ 4.49
KDM2AQ9Y2K7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
KDM2AQ9Y2K7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
KDM2AQ9Y2K7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
KDM2AQ9Y2K7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
KDM2AQ9Y2K7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC42.75■■■■■ 4.43
KDM2AQ9Y2K7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
KDM2AQ9Y2K7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
KDM2AQ9Y2K7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC42.59■■■■■ 4.41
KDM2AQ9Y2K7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
KDM2AQ9Y2K7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
KDM2AQ9Y2K7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
KDM2AQ9Y2K7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC42.46■■■■■ 4.39
KDM2AQ9Y2K7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
KDM2AQ9Y2K7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.34■■■■■ 4.37
KDM2AQ9Y2K7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC42.34■■■■■ 4.37
KDM2AQ9Y2K7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
KDM2AQ9Y2K7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC42.29■■■■■ 4.36
KDM2AQ9Y2K7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
KDM2AQ9Y2K7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC42.27■■■■■ 4.36
KDM2AQ9Y2K7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
KDM2AQ9Y2K7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
KDM2AQ9Y2K7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
KDM2AQ9Y2K7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.21■■■■■ 4.35
KDM2AQ9Y2K7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
KDM2AQ9Y2K7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
KDM2AQ9Y2K7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC42.13■■■■■ 4.33
KDM2AQ9Y2K7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
KDM2AQ9Y2K7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
KDM2AQ9Y2K7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
KDM2AQ9Y2K7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.07■■■■■ 4.33
KDM2AQ9Y2K7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
KDM2AQ9Y2K7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
KDM2AQ9Y2K7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC42.03■■■■■ 4.32
KDM2AQ9Y2K7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
KDM2AQ9Y2K7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC41.95■■■■■ 4.31
KDM2AQ9Y2K7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC41.95■■■■■ 4.31
KDM2AQ9Y2K7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
KDM2AQ9Y2K7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.92■■■■■ 4.3
KDM2AQ9Y2K7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
KDM2AQ9Y2K7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms