Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2A9

B3GNT3, N-acetyllactosaminide beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3GNT3Q9Y2A9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
B3GNT3Q9Y2A9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
B3GNT3Q9Y2A9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
B3GNT3Q9Y2A9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
B3GNT3Q9Y2A9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
B3GNT3Q9Y2A9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
B3GNT3Q9Y2A9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
B3GNT3Q9Y2A9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
B3GNT3Q9Y2A9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
B3GNT3Q9Y2A9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
B3GNT3Q9Y2A9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
B3GNT3Q9Y2A9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
B3GNT3Q9Y2A9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
B3GNT3Q9Y2A9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
B3GNT3Q9Y2A9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
B3GNT3Q9Y2A9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
B3GNT3Q9Y2A9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
B3GNT3Q9Y2A9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
B3GNT3Q9Y2A9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
B3GNT3Q9Y2A9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
B3GNT3Q9Y2A9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
B3GNT3Q9Y2A9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
B3GNT3Q9Y2A9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
B3GNT3Q9Y2A9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
B3GNT3Q9Y2A9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
B3GNT3Q9Y2A9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
B3GNT3Q9Y2A9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
B3GNT3Q9Y2A9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
B3GNT3Q9Y2A9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
B3GNT3Q9Y2A9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
B3GNT3Q9Y2A9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
B3GNT3Q9Y2A9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
B3GNT3Q9Y2A9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
B3GNT3Q9Y2A9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
B3GNT3Q9Y2A9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
B3GNT3Q9Y2A9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
B3GNT3Q9Y2A9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
B3GNT3Q9Y2A9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
B3GNT3Q9Y2A9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
B3GNT3Q9Y2A9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
B3GNT3Q9Y2A9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
B3GNT3Q9Y2A9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
B3GNT3Q9Y2A9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
B3GNT3Q9Y2A9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
B3GNT3Q9Y2A9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
B3GNT3Q9Y2A9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
B3GNT3Q9Y2A9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
B3GNT3Q9Y2A9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
B3GNT3Q9Y2A9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
B3GNT3Q9Y2A9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
B3GNT3Q9Y2A9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
B3GNT3Q9Y2A9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
B3GNT3Q9Y2A9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
B3GNT3Q9Y2A9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
B3GNT3Q9Y2A9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
B3GNT3Q9Y2A9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
B3GNT3Q9Y2A9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
B3GNT3Q9Y2A9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
B3GNT3Q9Y2A9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
B3GNT3Q9Y2A9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
B3GNT3Q9Y2A9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
B3GNT3Q9Y2A9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
B3GNT3Q9Y2A9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
B3GNT3Q9Y2A9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
B3GNT3Q9Y2A9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
B3GNT3Q9Y2A9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
B3GNT3Q9Y2A9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
B3GNT3Q9Y2A9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
B3GNT3Q9Y2A9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
B3GNT3Q9Y2A9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
B3GNT3Q9Y2A9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
B3GNT3Q9Y2A9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
B3GNT3Q9Y2A9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
B3GNT3Q9Y2A9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
B3GNT3Q9Y2A9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
B3GNT3Q9Y2A9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
B3GNT3Q9Y2A9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
B3GNT3Q9Y2A9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
B3GNT3Q9Y2A9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
B3GNT3Q9Y2A9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
B3GNT3Q9Y2A9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
B3GNT3Q9Y2A9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
B3GNT3Q9Y2A9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
B3GNT3Q9Y2A9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
B3GNT3Q9Y2A9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
B3GNT3Q9Y2A9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
B3GNT3Q9Y2A9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
B3GNT3Q9Y2A9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
B3GNT3Q9Y2A9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
B3GNT3Q9Y2A9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
B3GNT3Q9Y2A9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
B3GNT3Q9Y2A9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
B3GNT3Q9Y2A9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
B3GNT3Q9Y2A9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
B3GNT3Q9Y2A9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
B3GNT3Q9Y2A9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
B3GNT3Q9Y2A9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
B3GNT3Q9Y2A9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
B3GNT3Q9Y2A9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
B3GNT3Q9Y2A9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms