Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN7

PPP6R1, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP6R1Q9UPN7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC51.64■■■■■ 5.86
PPP6R1Q9UPN7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC51.64■■■■■ 5.86
PPP6R1Q9UPN7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC50.92■■■■■ 5.74
PPP6R1Q9UPN7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.52■■■■■ 5.68
PPP6R1Q9UPN7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.86■■■■■ 5.57
PPP6R1Q9UPN7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.44■■■■■ 5.5
PPP6R1Q9UPN7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.3■■■■■ 5.48
PPP6R1Q9UPN7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.13■■■■■ 5.46
PPP6R1Q9UPN7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC49.06■■■■■ 5.44
PPP6R1Q9UPN7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.01■■■■■ 5.44
PPP6R1Q9UPN7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC48.94■■■■■ 5.42
PPP6R1Q9UPN7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC48.77■■■■■ 5.4
PPP6R1Q9UPN7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC48.72■■■■■ 5.39
PPP6R1Q9UPN7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC48.7■■■■■ 5.39
PPP6R1Q9UPN7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.58■■■■■ 5.37
PPP6R1Q9UPN7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.45■■■■■ 5.35
PPP6R1Q9UPN7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.07■■■■■ 5.29
PPP6R1Q9UPN7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.01■■■■■ 5.28
PPP6R1Q9UPN7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.8■■■■■ 5.24
PPP6R1Q9UPN7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.62■■■■■ 5.21
PPP6R1Q9UPN7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC47.62■■■■■ 5.21
PPP6R1Q9UPN7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.6■■■■■ 5.21
PPP6R1Q9UPN7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC47.58■■■■■ 5.21
PPP6R1Q9UPN7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.56■■■■■ 5.2
PPP6R1Q9UPN7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.47■■■■■ 5.19
PPP6R1Q9UPN7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.42■■■■■ 5.18
PPP6R1Q9UPN7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC47.26■■■■■ 5.16
PPP6R1Q9UPN7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.24■■■■■ 5.15
PPP6R1Q9UPN7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC47.13■■■■■ 5.14
PPP6R1Q9UPN7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC47.11■■■■■ 5.13
PPP6R1Q9UPN7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC47.05■■■■■ 5.12
PPP6R1Q9UPN7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC46.85■■■■■ 5.09
PPP6R1Q9UPN7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.84■■■■■ 5.09
PPP6R1Q9UPN7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC46.63■■■■■ 5.06
PPP6R1Q9UPN7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC46.61■■■■■ 5.05
PPP6R1Q9UPN7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC46.58■■■■■ 5.05
PPP6R1Q9UPN7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.42■■■■■ 5.02
PPP6R1Q9UPN7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC46.42■■■■■ 5.02
PPP6R1Q9UPN7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
PPP6R1Q9UPN7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
PPP6R1Q9UPN7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC45.86■■■■■ 4.93
PPP6R1Q9UPN7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC45.84■■■■■ 4.93
PPP6R1Q9UPN7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
PPP6R1Q9UPN7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
PPP6R1Q9UPN7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.9
PPP6R1Q9UPN7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.59■■■■■ 4.89
PPP6R1Q9UPN7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
PPP6R1Q9UPN7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC45.5■■■■■ 4.87
PPP6R1Q9UPN7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
PPP6R1Q9UPN7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
PPP6R1Q9UPN7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC45.4■■■■■ 4.86
PPP6R1Q9UPN7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC45.4■■■■■ 4.86
PPP6R1Q9UPN7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
PPP6R1Q9UPN7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
PPP6R1Q9UPN7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC45.38■■■■■ 4.86
PPP6R1Q9UPN7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
PPP6R1Q9UPN7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
PPP6R1Q9UPN7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC45.22■■■■■ 4.83
PPP6R1Q9UPN7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC45.2■■■■■ 4.83
PPP6R1Q9UPN7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC45.18■■■■■ 4.82
PPP6R1Q9UPN7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
PPP6R1Q9UPN7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
PPP6R1Q9UPN7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC44.96■■■■■ 4.79
PPP6R1Q9UPN7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.93■■■■■ 4.78
PPP6R1Q9UPN7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
PPP6R1Q9UPN7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.9■■■■■ 4.78
PPP6R1Q9UPN7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
PPP6R1Q9UPN7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.88■■■■■ 4.78
PPP6R1Q9UPN7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
PPP6R1Q9UPN7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
PPP6R1Q9UPN7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC44.7■■■■■ 4.75
PPP6R1Q9UPN7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
PPP6R1Q9UPN7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
PPP6R1Q9UPN7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
PPP6R1Q9UPN7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC44.64■■■■■ 4.74
PPP6R1Q9UPN7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
PPP6R1Q9UPN7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC44.6■■■■■ 4.73
PPP6R1Q9UPN7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC44.55■■■■■ 4.72
PPP6R1Q9UPN7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
PPP6R1Q9UPN7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC44.49■■■■■ 4.71
PPP6R1Q9UPN7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC44.48■■■■■ 4.71
PPP6R1Q9UPN7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
PPP6R1Q9UPN7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
PPP6R1Q9UPN7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
PPP6R1Q9UPN7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC44.4■■■■■ 4.7
PPP6R1Q9UPN7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
PPP6R1Q9UPN7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC44.33■■■■■ 4.69
PPP6R1Q9UPN7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
PPP6R1Q9UPN7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
PPP6R1Q9UPN7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC44.25■■■■■ 4.67
PPP6R1Q9UPN7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
PPP6R1Q9UPN7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
PPP6R1Q9UPN7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
PPP6R1Q9UPN7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC44.13■■■■■ 4.66
PPP6R1Q9UPN7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC44.11■■■■■ 4.65
PPP6R1Q9UPN7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC44.1■■■■■ 4.65
PPP6R1Q9UPN7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC44.08■■■■■ 4.65
PPP6R1Q9UPN7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC44.08■■■■■ 4.65
PPP6R1Q9UPN7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC44.07■■■■■ 4.65
PPP6R1Q9UPN7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.03■■■■■ 4.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.7 ms