Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN72

PCDHA7, Protocadherin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA7Q9UN72 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
PCDHA7Q9UN72 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.24■■■■□ 3.71
PCDHA7Q9UN72 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
PCDHA7Q9UN72 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
PCDHA7Q9UN72 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
PCDHA7Q9UN72 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
PCDHA7Q9UN72 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
PCDHA7Q9UN72 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PCDHA7Q9UN72 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PCDHA7Q9UN72 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
PCDHA7Q9UN72 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PCDHA7Q9UN72 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
PCDHA7Q9UN72 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PCDHA7Q9UN72 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
PCDHA7Q9UN72 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PCDHA7Q9UN72 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
PCDHA7Q9UN72 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PCDHA7Q9UN72 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PCDHA7Q9UN72 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PCDHA7Q9UN72 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PCDHA7Q9UN72 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PCDHA7Q9UN72 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.67■■■■□ 3.3
PCDHA7Q9UN72 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PCDHA7Q9UN72 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PCDHA7Q9UN72 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
PCDHA7Q9UN72 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PCDHA7Q9UN72 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PCDHA7Q9UN72 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PCDHA7Q9UN72 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PCDHA7Q9UN72 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PCDHA7Q9UN72 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PCDHA7Q9UN72 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PCDHA7Q9UN72 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PCDHA7Q9UN72 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
PCDHA7Q9UN72 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
PCDHA7Q9UN72 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
PCDHA7Q9UN72 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PCDHA7Q9UN72 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PCDHA7Q9UN72 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PCDHA7Q9UN72 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PCDHA7Q9UN72 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PCDHA7Q9UN72 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PCDHA7Q9UN72 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
PCDHA7Q9UN72 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PCDHA7Q9UN72 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PCDHA7Q9UN72 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
PCDHA7Q9UN72 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PCDHA7Q9UN72 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PCDHA7Q9UN72 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PCDHA7Q9UN72 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PCDHA7Q9UN72 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PCDHA7Q9UN72 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PCDHA7Q9UN72 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PCDHA7Q9UN72 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PCDHA7Q9UN72 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PCDHA7Q9UN72 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PCDHA7Q9UN72 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PCDHA7Q9UN72 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PCDHA7Q9UN72 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PCDHA7Q9UN72 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PCDHA7Q9UN72 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PCDHA7Q9UN72 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PCDHA7Q9UN72 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PCDHA7Q9UN72 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PCDHA7Q9UN72 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PCDHA7Q9UN72 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PCDHA7Q9UN72 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PCDHA7Q9UN72 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PCDHA7Q9UN72 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PCDHA7Q9UN72 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PCDHA7Q9UN72 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PCDHA7Q9UN72 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PCDHA7Q9UN72 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PCDHA7Q9UN72 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PCDHA7Q9UN72 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PCDHA7Q9UN72 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PCDHA7Q9UN72 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PCDHA7Q9UN72 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PCDHA7Q9UN72 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PCDHA7Q9UN72 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PCDHA7Q9UN72 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PCDHA7Q9UN72 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PCDHA7Q9UN72 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PCDHA7Q9UN72 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PCDHA7Q9UN72 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PCDHA7Q9UN72 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
PCDHA7Q9UN72 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PCDHA7Q9UN72 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PCDHA7Q9UN72 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PCDHA7Q9UN72 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
PCDHA7Q9UN72 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PCDHA7Q9UN72 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PCDHA7Q9UN72 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PCDHA7Q9UN72 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PCDHA7Q9UN72 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PCDHA7Q9UN72 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
PCDHA7Q9UN72 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PCDHA7Q9UN72 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PCDHA7Q9UN72 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
PCDHA7Q9UN72 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms