Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN1

CACNG4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG4Q9UBN1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CACNG4Q9UBN1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CACNG4Q9UBN1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CACNG4Q9UBN1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CACNG4Q9UBN1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
CACNG4Q9UBN1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
CACNG4Q9UBN1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
CACNG4Q9UBN1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CACNG4Q9UBN1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CACNG4Q9UBN1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CACNG4Q9UBN1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CACNG4Q9UBN1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CACNG4Q9UBN1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CACNG4Q9UBN1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CACNG4Q9UBN1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CACNG4Q9UBN1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CACNG4Q9UBN1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CACNG4Q9UBN1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CACNG4Q9UBN1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CACNG4Q9UBN1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CACNG4Q9UBN1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CACNG4Q9UBN1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CACNG4Q9UBN1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CACNG4Q9UBN1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CACNG4Q9UBN1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CACNG4Q9UBN1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CACNG4Q9UBN1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CACNG4Q9UBN1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CACNG4Q9UBN1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CACNG4Q9UBN1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CACNG4Q9UBN1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CACNG4Q9UBN1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CACNG4Q9UBN1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CACNG4Q9UBN1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CACNG4Q9UBN1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CACNG4Q9UBN1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CACNG4Q9UBN1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CACNG4Q9UBN1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CACNG4Q9UBN1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
CACNG4Q9UBN1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CACNG4Q9UBN1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CACNG4Q9UBN1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CACNG4Q9UBN1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CACNG4Q9UBN1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CACNG4Q9UBN1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CACNG4Q9UBN1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CACNG4Q9UBN1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
CACNG4Q9UBN1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CACNG4Q9UBN1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
CACNG4Q9UBN1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CACNG4Q9UBN1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CACNG4Q9UBN1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CACNG4Q9UBN1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CACNG4Q9UBN1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CACNG4Q9UBN1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CACNG4Q9UBN1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CACNG4Q9UBN1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CACNG4Q9UBN1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CACNG4Q9UBN1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CACNG4Q9UBN1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CACNG4Q9UBN1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CACNG4Q9UBN1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CACNG4Q9UBN1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CACNG4Q9UBN1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CACNG4Q9UBN1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CACNG4Q9UBN1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CACNG4Q9UBN1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CACNG4Q9UBN1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CACNG4Q9UBN1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
CACNG4Q9UBN1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CACNG4Q9UBN1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CACNG4Q9UBN1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CACNG4Q9UBN1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CACNG4Q9UBN1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CACNG4Q9UBN1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CACNG4Q9UBN1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CACNG4Q9UBN1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CACNG4Q9UBN1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CACNG4Q9UBN1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CACNG4Q9UBN1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CACNG4Q9UBN1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CACNG4Q9UBN1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CACNG4Q9UBN1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CACNG4Q9UBN1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CACNG4Q9UBN1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CACNG4Q9UBN1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CACNG4Q9UBN1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CACNG4Q9UBN1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
CACNG4Q9UBN1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CACNG4Q9UBN1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CACNG4Q9UBN1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CACNG4Q9UBN1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CACNG4Q9UBN1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CACNG4Q9UBN1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CACNG4Q9UBN1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CACNG4Q9UBN1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CACNG4Q9UBN1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CACNG4Q9UBN1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CACNG4Q9UBN1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CACNG4Q9UBN1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms