Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXB0

MKS1, Meckel syndrome type 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1Q9NXB0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
MKS1Q9NXB0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
MKS1Q9NXB0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
MKS1Q9NXB0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
MKS1Q9NXB0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
MKS1Q9NXB0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
MKS1Q9NXB0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
MKS1Q9NXB0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
MKS1Q9NXB0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
MKS1Q9NXB0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
MKS1Q9NXB0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
MKS1Q9NXB0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
MKS1Q9NXB0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
MKS1Q9NXB0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
MKS1Q9NXB0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
MKS1Q9NXB0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
MKS1Q9NXB0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
MKS1Q9NXB0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
MKS1Q9NXB0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
MKS1Q9NXB0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
MKS1Q9NXB0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
MKS1Q9NXB0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
MKS1Q9NXB0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
MKS1Q9NXB0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
MKS1Q9NXB0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
MKS1Q9NXB0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
MKS1Q9NXB0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
MKS1Q9NXB0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
MKS1Q9NXB0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
MKS1Q9NXB0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
MKS1Q9NXB0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
MKS1Q9NXB0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
MKS1Q9NXB0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
MKS1Q9NXB0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
MKS1Q9NXB0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
MKS1Q9NXB0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
MKS1Q9NXB0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MKS1Q9NXB0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
MKS1Q9NXB0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
MKS1Q9NXB0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MKS1Q9NXB0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
MKS1Q9NXB0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
MKS1Q9NXB0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MKS1Q9NXB0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MKS1Q9NXB0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MKS1Q9NXB0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
MKS1Q9NXB0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MKS1Q9NXB0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MKS1Q9NXB0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MKS1Q9NXB0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MKS1Q9NXB0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MKS1Q9NXB0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
MKS1Q9NXB0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MKS1Q9NXB0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MKS1Q9NXB0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MKS1Q9NXB0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
MKS1Q9NXB0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MKS1Q9NXB0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MKS1Q9NXB0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MKS1Q9NXB0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MKS1Q9NXB0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MKS1Q9NXB0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MKS1Q9NXB0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
MKS1Q9NXB0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MKS1Q9NXB0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MKS1Q9NXB0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MKS1Q9NXB0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MKS1Q9NXB0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MKS1Q9NXB0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MKS1Q9NXB0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MKS1Q9NXB0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MKS1Q9NXB0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MKS1Q9NXB0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MKS1Q9NXB0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MKS1Q9NXB0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MKS1Q9NXB0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MKS1Q9NXB0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MKS1Q9NXB0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MKS1Q9NXB0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MKS1Q9NXB0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MKS1Q9NXB0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MKS1Q9NXB0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MKS1Q9NXB0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MKS1Q9NXB0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MKS1Q9NXB0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MKS1Q9NXB0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MKS1Q9NXB0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MKS1Q9NXB0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MKS1Q9NXB0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
MKS1Q9NXB0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MKS1Q9NXB0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MKS1Q9NXB0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MKS1Q9NXB0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MKS1Q9NXB0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MKS1Q9NXB0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MKS1Q9NXB0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MKS1Q9NXB0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MKS1Q9NXB0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MKS1Q9NXB0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MKS1Q9NXB0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 287.5 ms