Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
A4GALTQ9NPC4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
A4GALTQ9NPC4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
A4GALTQ9NPC4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
A4GALTQ9NPC4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
A4GALTQ9NPC4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
A4GALTQ9NPC4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
A4GALTQ9NPC4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
A4GALTQ9NPC4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
A4GALTQ9NPC4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
A4GALTQ9NPC4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
A4GALTQ9NPC4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
A4GALTQ9NPC4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
A4GALTQ9NPC4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
A4GALTQ9NPC4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
A4GALTQ9NPC4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
A4GALTQ9NPC4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
A4GALTQ9NPC4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
A4GALTQ9NPC4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
A4GALTQ9NPC4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
A4GALTQ9NPC4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
A4GALTQ9NPC4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
A4GALTQ9NPC4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
A4GALTQ9NPC4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
A4GALTQ9NPC4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
A4GALTQ9NPC4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
A4GALTQ9NPC4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
A4GALTQ9NPC4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
A4GALTQ9NPC4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
A4GALTQ9NPC4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
A4GALTQ9NPC4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
A4GALTQ9NPC4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
A4GALTQ9NPC4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
A4GALTQ9NPC4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
A4GALTQ9NPC4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
A4GALTQ9NPC4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
A4GALTQ9NPC4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
A4GALTQ9NPC4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
A4GALTQ9NPC4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
A4GALTQ9NPC4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
A4GALTQ9NPC4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
A4GALTQ9NPC4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
A4GALTQ9NPC4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
A4GALTQ9NPC4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
A4GALTQ9NPC4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
A4GALTQ9NPC4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
A4GALTQ9NPC4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
A4GALTQ9NPC4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
A4GALTQ9NPC4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
A4GALTQ9NPC4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
A4GALTQ9NPC4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
A4GALTQ9NPC4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
A4GALTQ9NPC4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
A4GALTQ9NPC4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
A4GALTQ9NPC4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
A4GALTQ9NPC4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
A4GALTQ9NPC4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
A4GALTQ9NPC4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
A4GALTQ9NPC4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
A4GALTQ9NPC4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
A4GALTQ9NPC4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
A4GALTQ9NPC4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
A4GALTQ9NPC4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
A4GALTQ9NPC4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
A4GALTQ9NPC4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
A4GALTQ9NPC4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
A4GALTQ9NPC4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
A4GALTQ9NPC4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
A4GALTQ9NPC4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
A4GALTQ9NPC4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
A4GALTQ9NPC4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
A4GALTQ9NPC4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
A4GALTQ9NPC4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
A4GALTQ9NPC4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
A4GALTQ9NPC4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
A4GALTQ9NPC4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
A4GALTQ9NPC4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
A4GALTQ9NPC4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
A4GALTQ9NPC4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
A4GALTQ9NPC4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
A4GALTQ9NPC4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
A4GALTQ9NPC4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
A4GALTQ9NPC4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
A4GALTQ9NPC4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
A4GALTQ9NPC4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
A4GALTQ9NPC4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
A4GALTQ9NPC4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
A4GALTQ9NPC4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
A4GALTQ9NPC4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
A4GALTQ9NPC4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
A4GALTQ9NPC4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
A4GALTQ9NPC4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
A4GALTQ9NPC4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
A4GALTQ9NPC4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
A4GALTQ9NPC4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
A4GALTQ9NPC4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
A4GALTQ9NPC4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
A4GALTQ9NPC4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
A4GALTQ9NPC4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
A4GALTQ9NPC4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms