Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3C7

GGNBP2, Gametogenetin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP2Q9H3C7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC47.12■■■■■ 5.13
GGNBP2Q9H3C7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC45.86■■■■■ 4.93
GGNBP2Q9H3C7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
GGNBP2Q9H3C7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
GGNBP2Q9H3C7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.89
GGNBP2Q9H3C7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.56■■■■■ 4.88
GGNBP2Q9H3C7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC45.4■■■■■ 4.86
GGNBP2Q9H3C7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.11■■■■■ 4.81
GGNBP2Q9H3C7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
GGNBP2Q9H3C7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC44.16■■■■■ 4.66
GGNBP2Q9H3C7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.05■■■■■ 4.64
GGNBP2Q9H3C7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC43.99■■■■■ 4.63
GGNBP2Q9H3C7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.93■■■■■ 4.62
GGNBP2Q9H3C7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC43.9■■■■■ 4.62
GGNBP2Q9H3C7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC43.84■■■■■ 4.61
GGNBP2Q9H3C7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC43.74■■■■■ 4.59
GGNBP2Q9H3C7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
GGNBP2Q9H3C7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC43.55■■■■■ 4.56
GGNBP2Q9H3C7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
GGNBP2Q9H3C7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.2■■■■■ 4.51
GGNBP2Q9H3C7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
GGNBP2Q9H3C7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
GGNBP2Q9H3C7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
GGNBP2Q9H3C7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC42.88■■■■■ 4.46
GGNBP2Q9H3C7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
GGNBP2Q9H3C7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
GGNBP2Q9H3C7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
GGNBP2Q9H3C7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC42.49■■■■■ 4.39
GGNBP2Q9H3C7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
GGNBP2Q9H3C7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC42.42■■■■■ 4.38
GGNBP2Q9H3C7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
GGNBP2Q9H3C7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
GGNBP2Q9H3C7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
GGNBP2Q9H3C7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
GGNBP2Q9H3C7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
GGNBP2Q9H3C7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
GGNBP2Q9H3C7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
GGNBP2Q9H3C7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
GGNBP2Q9H3C7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
GGNBP2Q9H3C7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC41.63■■■■■ 4.25
GGNBP2Q9H3C7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
GGNBP2Q9H3C7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
GGNBP2Q9H3C7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
GGNBP2Q9H3C7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC41.49■■■■■ 4.23
GGNBP2Q9H3C7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
GGNBP2Q9H3C7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC41.41■■■■■ 4.22
GGNBP2Q9H3C7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC41.41■■■■■ 4.22
GGNBP2Q9H3C7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
GGNBP2Q9H3C7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
GGNBP2Q9H3C7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
GGNBP2Q9H3C7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
GGNBP2Q9H3C7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
GGNBP2Q9H3C7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC41.04■■■■■ 4.16
GGNBP2Q9H3C7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
GGNBP2Q9H3C7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
GGNBP2Q9H3C7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
GGNBP2Q9H3C7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
GGNBP2Q9H3C7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
GGNBP2Q9H3C7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
GGNBP2Q9H3C7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
GGNBP2Q9H3C7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
GGNBP2Q9H3C7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
GGNBP2Q9H3C7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
GGNBP2Q9H3C7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC40.59■■■■■ 4.09
GGNBP2Q9H3C7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC40.55■■■■■ 4.08
GGNBP2Q9H3C7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC40.54■■■■■ 4.08
GGNBP2Q9H3C7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
GGNBP2Q9H3C7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
GGNBP2Q9H3C7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC40.44■■■■■ 4.06
GGNBP2Q9H3C7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
GGNBP2Q9H3C7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
GGNBP2Q9H3C7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC40.34■■■■■ 4.05
GGNBP2Q9H3C7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
GGNBP2Q9H3C7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
GGNBP2Q9H3C7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
GGNBP2Q9H3C7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
GGNBP2Q9H3C7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
GGNBP2Q9H3C7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
GGNBP2Q9H3C7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
GGNBP2Q9H3C7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
GGNBP2Q9H3C7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
GGNBP2Q9H3C7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
GGNBP2Q9H3C7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
GGNBP2Q9H3C7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4.01
GGNBP2Q9H3C7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
GGNBP2Q9H3C7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
GGNBP2Q9H3C7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
GGNBP2Q9H3C7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
GGNBP2Q9H3C7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
GGNBP2Q9H3C7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
GGNBP2Q9H3C7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC39.96■■■■□ 3.99
GGNBP2Q9H3C7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC39.94■■■■□ 3.98
GGNBP2Q9H3C7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
GGNBP2Q9H3C7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
GGNBP2Q9H3C7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
GGNBP2Q9H3C7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
GGNBP2Q9H3C7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
GGNBP2Q9H3C7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
GGNBP2Q9H3C7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
GGNBP2Q9H3C7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms