Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1M0

NUP62CL, Nucleoporin-62 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62CLQ9H1M0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
NUP62CLQ9H1M0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
NUP62CLQ9H1M0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.77■■■■□ 3.64
NUP62CLQ9H1M0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.42■■■■□ 3.58
NUP62CLQ9H1M0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
NUP62CLQ9H1M0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
NUP62CLQ9H1M0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
NUP62CLQ9H1M0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
NUP62CLQ9H1M0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
NUP62CLQ9H1M0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
NUP62CLQ9H1M0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
NUP62CLQ9H1M0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
NUP62CLQ9H1M0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
NUP62CLQ9H1M0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
NUP62CLQ9H1M0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
NUP62CLQ9H1M0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
NUP62CLQ9H1M0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NUP62CLQ9H1M0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
NUP62CLQ9H1M0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
NUP62CLQ9H1M0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
NUP62CLQ9H1M0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
NUP62CLQ9H1M0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
NUP62CLQ9H1M0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
NUP62CLQ9H1M0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
NUP62CLQ9H1M0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
NUP62CLQ9H1M0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
NUP62CLQ9H1M0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NUP62CLQ9H1M0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NUP62CLQ9H1M0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NUP62CLQ9H1M0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
NUP62CLQ9H1M0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
NUP62CLQ9H1M0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
NUP62CLQ9H1M0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
NUP62CLQ9H1M0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NUP62CLQ9H1M0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NUP62CLQ9H1M0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NUP62CLQ9H1M0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
NUP62CLQ9H1M0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NUP62CLQ9H1M0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NUP62CLQ9H1M0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NUP62CLQ9H1M0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NUP62CLQ9H1M0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NUP62CLQ9H1M0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NUP62CLQ9H1M0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NUP62CLQ9H1M0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NUP62CLQ9H1M0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NUP62CLQ9H1M0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NUP62CLQ9H1M0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NUP62CLQ9H1M0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NUP62CLQ9H1M0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NUP62CLQ9H1M0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NUP62CLQ9H1M0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
NUP62CLQ9H1M0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NUP62CLQ9H1M0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NUP62CLQ9H1M0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NUP62CLQ9H1M0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NUP62CLQ9H1M0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
NUP62CLQ9H1M0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
NUP62CLQ9H1M0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NUP62CLQ9H1M0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
NUP62CLQ9H1M0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NUP62CLQ9H1M0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NUP62CLQ9H1M0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NUP62CLQ9H1M0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
NUP62CLQ9H1M0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NUP62CLQ9H1M0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NUP62CLQ9H1M0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NUP62CLQ9H1M0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NUP62CLQ9H1M0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NUP62CLQ9H1M0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NUP62CLQ9H1M0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NUP62CLQ9H1M0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NUP62CLQ9H1M0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NUP62CLQ9H1M0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NUP62CLQ9H1M0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NUP62CLQ9H1M0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NUP62CLQ9H1M0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NUP62CLQ9H1M0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NUP62CLQ9H1M0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NUP62CLQ9H1M0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NUP62CLQ9H1M0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
NUP62CLQ9H1M0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NUP62CLQ9H1M0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NUP62CLQ9H1M0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NUP62CLQ9H1M0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
NUP62CLQ9H1M0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NUP62CLQ9H1M0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NUP62CLQ9H1M0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
NUP62CLQ9H1M0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NUP62CLQ9H1M0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
NUP62CLQ9H1M0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NUP62CLQ9H1M0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NUP62CLQ9H1M0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NUP62CLQ9H1M0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NUP62CLQ9H1M0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NUP62CLQ9H1M0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
NUP62CLQ9H1M0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
NUP62CLQ9H1M0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NUP62CLQ9H1M0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NUP62CLQ9H1M0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms