Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
TM6SF1Q9BZW5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC40.13■■■■■ 4.01
TM6SF1Q9BZW5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
TM6SF1Q9BZW5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
TM6SF1Q9BZW5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
TM6SF1Q9BZW5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
TM6SF1Q9BZW5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
TM6SF1Q9BZW5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
TM6SF1Q9BZW5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
TM6SF1Q9BZW5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
TM6SF1Q9BZW5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
TM6SF1Q9BZW5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC38.12■■■■□ 3.69
TM6SF1Q9BZW5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
TM6SF1Q9BZW5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
TM6SF1Q9BZW5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
TM6SF1Q9BZW5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
TM6SF1Q9BZW5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
TM6SF1Q9BZW5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
TM6SF1Q9BZW5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
TM6SF1Q9BZW5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
TM6SF1Q9BZW5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
TM6SF1Q9BZW5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
TM6SF1Q9BZW5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
TM6SF1Q9BZW5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
TM6SF1Q9BZW5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
TM6SF1Q9BZW5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
TM6SF1Q9BZW5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
TM6SF1Q9BZW5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
TM6SF1Q9BZW5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
TM6SF1Q9BZW5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
TM6SF1Q9BZW5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
TM6SF1Q9BZW5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
TM6SF1Q9BZW5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
TM6SF1Q9BZW5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
TM6SF1Q9BZW5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
TM6SF1Q9BZW5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
TM6SF1Q9BZW5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
TM6SF1Q9BZW5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TM6SF1Q9BZW5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
TM6SF1Q9BZW5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
TM6SF1Q9BZW5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
TM6SF1Q9BZW5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TM6SF1Q9BZW5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
TM6SF1Q9BZW5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
TM6SF1Q9BZW5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
TM6SF1Q9BZW5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
TM6SF1Q9BZW5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TM6SF1Q9BZW5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
TM6SF1Q9BZW5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
TM6SF1Q9BZW5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
TM6SF1Q9BZW5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
TM6SF1Q9BZW5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
TM6SF1Q9BZW5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
TM6SF1Q9BZW5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
TM6SF1Q9BZW5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TM6SF1Q9BZW5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
TM6SF1Q9BZW5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
TM6SF1Q9BZW5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
TM6SF1Q9BZW5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
TM6SF1Q9BZW5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
TM6SF1Q9BZW5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TM6SF1Q9BZW5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TM6SF1Q9BZW5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TM6SF1Q9BZW5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TM6SF1Q9BZW5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TM6SF1Q9BZW5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TM6SF1Q9BZW5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TM6SF1Q9BZW5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TM6SF1Q9BZW5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
TM6SF1Q9BZW5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
TM6SF1Q9BZW5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TM6SF1Q9BZW5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
TM6SF1Q9BZW5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
TM6SF1Q9BZW5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TM6SF1Q9BZW5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
TM6SF1Q9BZW5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
TM6SF1Q9BZW5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
TM6SF1Q9BZW5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
TM6SF1Q9BZW5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
TM6SF1Q9BZW5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TM6SF1Q9BZW5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
TM6SF1Q9BZW5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TM6SF1Q9BZW5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TM6SF1Q9BZW5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
TM6SF1Q9BZW5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
TM6SF1Q9BZW5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
TM6SF1Q9BZW5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
TM6SF1Q9BZW5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TM6SF1Q9BZW5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TM6SF1Q9BZW5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TM6SF1Q9BZW5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TM6SF1Q9BZW5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TM6SF1Q9BZW5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TM6SF1Q9BZW5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TM6SF1Q9BZW5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TM6SF1Q9BZW5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TM6SF1Q9BZW5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TM6SF1Q9BZW5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TM6SF1Q9BZW5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TM6SF1Q9BZW5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
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