Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
EDEM3Q9BZQ6 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.18■■■■□ 3.38
EDEM3Q9BZQ6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
EDEM3Q9BZQ6 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
EDEM3Q9BZQ6 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
EDEM3Q9BZQ6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
EDEM3Q9BZQ6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
EDEM3Q9BZQ6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
EDEM3Q9BZQ6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
EDEM3Q9BZQ6 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
EDEM3Q9BZQ6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
EDEM3Q9BZQ6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
EDEM3Q9BZQ6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
EDEM3Q9BZQ6 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
EDEM3Q9BZQ6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
EDEM3Q9BZQ6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
EDEM3Q9BZQ6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
EDEM3Q9BZQ6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
EDEM3Q9BZQ6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
EDEM3Q9BZQ6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
EDEM3Q9BZQ6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
EDEM3Q9BZQ6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
EDEM3Q9BZQ6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
EDEM3Q9BZQ6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
EDEM3Q9BZQ6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
EDEM3Q9BZQ6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
EDEM3Q9BZQ6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
EDEM3Q9BZQ6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
EDEM3Q9BZQ6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
EDEM3Q9BZQ6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
EDEM3Q9BZQ6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
EDEM3Q9BZQ6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
EDEM3Q9BZQ6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
EDEM3Q9BZQ6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
EDEM3Q9BZQ6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
EDEM3Q9BZQ6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
EDEM3Q9BZQ6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
EDEM3Q9BZQ6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
EDEM3Q9BZQ6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
EDEM3Q9BZQ6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
EDEM3Q9BZQ6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
EDEM3Q9BZQ6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
EDEM3Q9BZQ6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
EDEM3Q9BZQ6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
EDEM3Q9BZQ6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
EDEM3Q9BZQ6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
EDEM3Q9BZQ6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
EDEM3Q9BZQ6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
EDEM3Q9BZQ6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
EDEM3Q9BZQ6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
EDEM3Q9BZQ6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
EDEM3Q9BZQ6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
EDEM3Q9BZQ6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
EDEM3Q9BZQ6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
EDEM3Q9BZQ6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
EDEM3Q9BZQ6 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
EDEM3Q9BZQ6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
EDEM3Q9BZQ6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
EDEM3Q9BZQ6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
EDEM3Q9BZQ6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
EDEM3Q9BZQ6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
EDEM3Q9BZQ6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
EDEM3Q9BZQ6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
EDEM3Q9BZQ6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
EDEM3Q9BZQ6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
EDEM3Q9BZQ6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
EDEM3Q9BZQ6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
EDEM3Q9BZQ6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
EDEM3Q9BZQ6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
EDEM3Q9BZQ6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
EDEM3Q9BZQ6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
EDEM3Q9BZQ6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
EDEM3Q9BZQ6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
EDEM3Q9BZQ6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
EDEM3Q9BZQ6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
EDEM3Q9BZQ6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
EDEM3Q9BZQ6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
EDEM3Q9BZQ6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
EDEM3Q9BZQ6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
EDEM3Q9BZQ6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
EDEM3Q9BZQ6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
EDEM3Q9BZQ6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
EDEM3Q9BZQ6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
EDEM3Q9BZQ6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
EDEM3Q9BZQ6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
EDEM3Q9BZQ6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
EDEM3Q9BZQ6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
EDEM3Q9BZQ6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
EDEM3Q9BZQ6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
EDEM3Q9BZQ6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
EDEM3Q9BZQ6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
EDEM3Q9BZQ6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
EDEM3Q9BZQ6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
EDEM3Q9BZQ6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
EDEM3Q9BZQ6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
EDEM3Q9BZQ6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
EDEM3Q9BZQ6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
EDEM3Q9BZQ6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
EDEM3Q9BZQ6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
EDEM3Q9BZQ6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms