Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
MCMBPQ9BTE3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
MCMBPQ9BTE3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
MCMBPQ9BTE3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33■■■□□ 2.87
MCMBPQ9BTE3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
MCMBPQ9BTE3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
MCMBPQ9BTE3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
MCMBPQ9BTE3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
MCMBPQ9BTE3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
MCMBPQ9BTE3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
MCMBPQ9BTE3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
MCMBPQ9BTE3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
MCMBPQ9BTE3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
MCMBPQ9BTE3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
MCMBPQ9BTE3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
MCMBPQ9BTE3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
MCMBPQ9BTE3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
MCMBPQ9BTE3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
MCMBPQ9BTE3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
MCMBPQ9BTE3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
MCMBPQ9BTE3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
MCMBPQ9BTE3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
MCMBPQ9BTE3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
MCMBPQ9BTE3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
MCMBPQ9BTE3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
MCMBPQ9BTE3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
MCMBPQ9BTE3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
MCMBPQ9BTE3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
MCMBPQ9BTE3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
MCMBPQ9BTE3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
MCMBPQ9BTE3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
MCMBPQ9BTE3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
MCMBPQ9BTE3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
MCMBPQ9BTE3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
MCMBPQ9BTE3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
MCMBPQ9BTE3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
MCMBPQ9BTE3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
MCMBPQ9BTE3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
MCMBPQ9BTE3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
MCMBPQ9BTE3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
MCMBPQ9BTE3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
MCMBPQ9BTE3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
MCMBPQ9BTE3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MCMBPQ9BTE3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
MCMBPQ9BTE3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
MCMBPQ9BTE3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MCMBPQ9BTE3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
MCMBPQ9BTE3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MCMBPQ9BTE3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MCMBPQ9BTE3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
MCMBPQ9BTE3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MCMBPQ9BTE3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MCMBPQ9BTE3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MCMBPQ9BTE3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
MCMBPQ9BTE3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MCMBPQ9BTE3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MCMBPQ9BTE3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MCMBPQ9BTE3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MCMBPQ9BTE3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MCMBPQ9BTE3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MCMBPQ9BTE3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MCMBPQ9BTE3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MCMBPQ9BTE3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MCMBPQ9BTE3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MCMBPQ9BTE3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MCMBPQ9BTE3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MCMBPQ9BTE3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MCMBPQ9BTE3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MCMBPQ9BTE3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MCMBPQ9BTE3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MCMBPQ9BTE3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MCMBPQ9BTE3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MCMBPQ9BTE3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MCMBPQ9BTE3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MCMBPQ9BTE3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MCMBPQ9BTE3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MCMBPQ9BTE3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MCMBPQ9BTE3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MCMBPQ9BTE3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MCMBPQ9BTE3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MCMBPQ9BTE3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
MCMBPQ9BTE3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MCMBPQ9BTE3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
MCMBPQ9BTE3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MCMBPQ9BTE3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
MCMBPQ9BTE3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MCMBPQ9BTE3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MCMBPQ9BTE3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MCMBPQ9BTE3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCMBPQ9BTE3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MCMBPQ9BTE3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MCMBPQ9BTE3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MCMBPQ9BTE3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MCMBPQ9BTE3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MCMBPQ9BTE3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MCMBPQ9BTE3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MCMBPQ9BTE3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MCMBPQ9BTE3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MCMBPQ9BTE3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MCMBPQ9BTE3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms