Protein–RNA interactions for Protein: Q96QA5

GSDMA, Gasdermin-A, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMAQ96QA5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
GSDMAQ96QA5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.51■■■■□ 3.6
GSDMAQ96QA5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
GSDMAQ96QA5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
GSDMAQ96QA5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
GSDMAQ96QA5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
GSDMAQ96QA5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
GSDMAQ96QA5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
GSDMAQ96QA5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
GSDMAQ96QA5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.14■■■■□ 3.38
GSDMAQ96QA5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
GSDMAQ96QA5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
GSDMAQ96QA5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
GSDMAQ96QA5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
GSDMAQ96QA5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
GSDMAQ96QA5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
GSDMAQ96QA5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
GSDMAQ96QA5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
GSDMAQ96QA5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
GSDMAQ96QA5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
GSDMAQ96QA5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
GSDMAQ96QA5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
GSDMAQ96QA5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
GSDMAQ96QA5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
GSDMAQ96QA5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
GSDMAQ96QA5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
GSDMAQ96QA5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
GSDMAQ96QA5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
GSDMAQ96QA5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
GSDMAQ96QA5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
GSDMAQ96QA5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
GSDMAQ96QA5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
GSDMAQ96QA5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
GSDMAQ96QA5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
GSDMAQ96QA5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
GSDMAQ96QA5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
GSDMAQ96QA5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
GSDMAQ96QA5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
GSDMAQ96QA5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
GSDMAQ96QA5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
GSDMAQ96QA5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
GSDMAQ96QA5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
GSDMAQ96QA5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
GSDMAQ96QA5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
GSDMAQ96QA5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
GSDMAQ96QA5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
GSDMAQ96QA5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
GSDMAQ96QA5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
GSDMAQ96QA5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
GSDMAQ96QA5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
GSDMAQ96QA5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
GSDMAQ96QA5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
GSDMAQ96QA5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
GSDMAQ96QA5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
GSDMAQ96QA5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
GSDMAQ96QA5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
GSDMAQ96QA5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
GSDMAQ96QA5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
GSDMAQ96QA5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GSDMAQ96QA5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
GSDMAQ96QA5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
GSDMAQ96QA5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
GSDMAQ96QA5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
GSDMAQ96QA5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
GSDMAQ96QA5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
GSDMAQ96QA5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
GSDMAQ96QA5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
GSDMAQ96QA5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
GSDMAQ96QA5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
GSDMAQ96QA5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
GSDMAQ96QA5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
GSDMAQ96QA5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
GSDMAQ96QA5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
GSDMAQ96QA5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
GSDMAQ96QA5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
GSDMAQ96QA5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
GSDMAQ96QA5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
GSDMAQ96QA5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GSDMAQ96QA5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
GSDMAQ96QA5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
GSDMAQ96QA5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
GSDMAQ96QA5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
GSDMAQ96QA5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
GSDMAQ96QA5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
GSDMAQ96QA5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GSDMAQ96QA5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
GSDMAQ96QA5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
GSDMAQ96QA5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
GSDMAQ96QA5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
GSDMAQ96QA5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
GSDMAQ96QA5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
GSDMAQ96QA5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GSDMAQ96QA5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
GSDMAQ96QA5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
GSDMAQ96QA5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
GSDMAQ96QA5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
GSDMAQ96QA5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GSDMAQ96QA5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
GSDMAQ96QA5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
GSDMAQ96QA5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms