Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU4

UHRF2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF2Q96PU4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UHRF2Q96PU4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UHRF2Q96PU4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UHRF2Q96PU4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
UHRF2Q96PU4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UHRF2Q96PU4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UHRF2Q96PU4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
UHRF2Q96PU4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UHRF2Q96PU4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UHRF2Q96PU4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UHRF2Q96PU4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UHRF2Q96PU4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UHRF2Q96PU4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UHRF2Q96PU4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UHRF2Q96PU4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UHRF2Q96PU4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UHRF2Q96PU4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UHRF2Q96PU4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UHRF2Q96PU4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UHRF2Q96PU4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UHRF2Q96PU4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UHRF2Q96PU4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UHRF2Q96PU4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UHRF2Q96PU4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UHRF2Q96PU4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UHRF2Q96PU4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UHRF2Q96PU4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UHRF2Q96PU4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UHRF2Q96PU4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UHRF2Q96PU4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UHRF2Q96PU4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UHRF2Q96PU4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UHRF2Q96PU4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UHRF2Q96PU4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UHRF2Q96PU4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UHRF2Q96PU4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UHRF2Q96PU4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UHRF2Q96PU4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UHRF2Q96PU4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UHRF2Q96PU4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UHRF2Q96PU4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UHRF2Q96PU4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UHRF2Q96PU4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UHRF2Q96PU4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
UHRF2Q96PU4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UHRF2Q96PU4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UHRF2Q96PU4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UHRF2Q96PU4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UHRF2Q96PU4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UHRF2Q96PU4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UHRF2Q96PU4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UHRF2Q96PU4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UHRF2Q96PU4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UHRF2Q96PU4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UHRF2Q96PU4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UHRF2Q96PU4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UHRF2Q96PU4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UHRF2Q96PU4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UHRF2Q96PU4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UHRF2Q96PU4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UHRF2Q96PU4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UHRF2Q96PU4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UHRF2Q96PU4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UHRF2Q96PU4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UHRF2Q96PU4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UHRF2Q96PU4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UHRF2Q96PU4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UHRF2Q96PU4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UHRF2Q96PU4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UHRF2Q96PU4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UHRF2Q96PU4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UHRF2Q96PU4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UHRF2Q96PU4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UHRF2Q96PU4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UHRF2Q96PU4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UHRF2Q96PU4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UHRF2Q96PU4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UHRF2Q96PU4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UHRF2Q96PU4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UHRF2Q96PU4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UHRF2Q96PU4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UHRF2Q96PU4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UHRF2Q96PU4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UHRF2Q96PU4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UHRF2Q96PU4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UHRF2Q96PU4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UHRF2Q96PU4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UHRF2Q96PU4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UHRF2Q96PU4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UHRF2Q96PU4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UHRF2Q96PU4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UHRF2Q96PU4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UHRF2Q96PU4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UHRF2Q96PU4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
UHRF2Q96PU4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UHRF2Q96PU4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UHRF2Q96PU4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UHRF2Q96PU4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UHRF2Q96PU4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UHRF2Q96PU4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms