Protein–RNA interactions for Protein: Q96M86

DNHD1, Dynein heavy chain domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 4,753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNHD1Q96M86 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DNHD1Q96M86 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DNHD1Q96M86 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DNHD1Q96M86 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DNHD1Q96M86 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DNHD1Q96M86 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DNHD1Q96M86 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DNHD1Q96M86 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DNHD1Q96M86 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DNHD1Q96M86 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DNHD1Q96M86 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DNHD1Q96M86 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DNHD1Q96M86 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
DNHD1Q96M86 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNHD1Q96M86 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNHD1Q96M86 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNHD1Q96M86 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DNHD1Q96M86 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DNHD1Q96M86 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
DNHD1Q96M86 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DNHD1Q96M86 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DNHD1Q96M86 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DNHD1Q96M86 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNHD1Q96M86 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNHD1Q96M86 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNHD1Q96M86 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNHD1Q96M86 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNHD1Q96M86 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNHD1Q96M86 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNHD1Q96M86 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNHD1Q96M86 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNHD1Q96M86 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNHD1Q96M86 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNHD1Q96M86 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
DNHD1Q96M86 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNHD1Q96M86 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNHD1Q96M86 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNHD1Q96M86 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNHD1Q96M86 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNHD1Q96M86 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNHD1Q96M86 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNHD1Q96M86 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNHD1Q96M86 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNHD1Q96M86 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
DNHD1Q96M86 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DNHD1Q96M86 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNHD1Q96M86 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNHD1Q96M86 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNHD1Q96M86 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNHD1Q96M86 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DNHD1Q96M86 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNHD1Q96M86 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNHD1Q96M86 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNHD1Q96M86 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
DNHD1Q96M86 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNHD1Q96M86 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNHD1Q96M86 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DNHD1Q96M86 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNHD1Q96M86 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNHD1Q96M86 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNHD1Q96M86 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNHD1Q96M86 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNHD1Q96M86 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNHD1Q96M86 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNHD1Q96M86 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DNHD1Q96M86 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNHD1Q96M86 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNHD1Q96M86 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNHD1Q96M86 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNHD1Q96M86 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNHD1Q96M86 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNHD1Q96M86 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNHD1Q96M86 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNHD1Q96M86 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNHD1Q96M86 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNHD1Q96M86 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNHD1Q96M86 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DNHD1Q96M86 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNHD1Q96M86 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNHD1Q96M86 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNHD1Q96M86 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DNHD1Q96M86 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNHD1Q96M86 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DNHD1Q96M86 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNHD1Q96M86 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNHD1Q96M86 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNHD1Q96M86 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DNHD1Q96M86 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNHD1Q96M86 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNHD1Q96M86 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNHD1Q96M86 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNHD1Q96M86 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNHD1Q96M86 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNHD1Q96M86 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNHD1Q96M86 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNHD1Q96M86 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNHD1Q96M86 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNHD1Q96M86 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
DNHD1Q96M86 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNHD1Q96M86 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms