Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC40.4■■■■■ 4.06
MKL1Q969V6 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
MKL1Q969V6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
MKL1Q969V6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
MKL1Q969V6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
MKL1Q969V6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
MKL1Q969V6 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
MKL1Q969V6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.61■■■■□ 3.77
MKL1Q969V6 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
MKL1Q969V6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
MKL1Q969V6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
MKL1Q969V6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
MKL1Q969V6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
MKL1Q969V6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
MKL1Q969V6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
MKL1Q969V6 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
MKL1Q969V6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
MKL1Q969V6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
MKL1Q969V6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
MKL1Q969V6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.51
MKL1Q969V6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
MKL1Q969V6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
MKL1Q969V6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
MKL1Q969V6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
MKL1Q969V6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
MKL1Q969V6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
MKL1Q969V6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
MKL1Q969V6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
MKL1Q969V6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
MKL1Q969V6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
MKL1Q969V6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
MKL1Q969V6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
MKL1Q969V6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
MKL1Q969V6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
MKL1Q969V6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
MKL1Q969V6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
MKL1Q969V6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
MKL1Q969V6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
MKL1Q969V6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
MKL1Q969V6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
MKL1Q969V6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
MKL1Q969V6 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
MKL1Q969V6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
MKL1Q969V6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
MKL1Q969V6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
MKL1Q969V6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
MKL1Q969V6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
MKL1Q969V6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
MKL1Q969V6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
MKL1Q969V6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
MKL1Q969V6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
MKL1Q969V6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
MKL1Q969V6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
MKL1Q969V6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
MKL1Q969V6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
MKL1Q969V6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
MKL1Q969V6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
MKL1Q969V6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
MKL1Q969V6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
MKL1Q969V6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
MKL1Q969V6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
MKL1Q969V6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
MKL1Q969V6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
MKL1Q969V6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
MKL1Q969V6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
MKL1Q969V6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
MKL1Q969V6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
MKL1Q969V6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
MKL1Q969V6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
MKL1Q969V6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
MKL1Q969V6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
MKL1Q969V6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
MKL1Q969V6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
MKL1Q969V6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
MKL1Q969V6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
MKL1Q969V6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
MKL1Q969V6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
MKL1Q969V6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
MKL1Q969V6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
MKL1Q969V6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
MKL1Q969V6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
MKL1Q969V6 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
MKL1Q969V6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
MKL1Q969V6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
MKL1Q969V6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
MKL1Q969V6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
MKL1Q969V6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
MKL1Q969V6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
MKL1Q969V6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
MKL1Q969V6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
MKL1Q969V6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
MKL1Q969V6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
MKL1Q969V6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
MKL1Q969V6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
MKL1Q969V6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
MKL1Q969V6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
MKL1Q969V6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
MKL1Q969V6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
MKL1Q969V6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
MKL1Q969V6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms