Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVF5

KCTD4, BTB/POZ domain-containing protein KCTD4, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD4Q8WVF5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
KCTD4Q8WVF5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
KCTD4Q8WVF5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
KCTD4Q8WVF5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
KCTD4Q8WVF5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
KCTD4Q8WVF5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
KCTD4Q8WVF5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
KCTD4Q8WVF5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
KCTD4Q8WVF5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
KCTD4Q8WVF5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
KCTD4Q8WVF5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
KCTD4Q8WVF5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
KCTD4Q8WVF5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
KCTD4Q8WVF5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
KCTD4Q8WVF5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
KCTD4Q8WVF5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
KCTD4Q8WVF5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
KCTD4Q8WVF5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
KCTD4Q8WVF5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
KCTD4Q8WVF5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
KCTD4Q8WVF5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
KCTD4Q8WVF5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
KCTD4Q8WVF5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.56
KCTD4Q8WVF5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
KCTD4Q8WVF5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
KCTD4Q8WVF5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
KCTD4Q8WVF5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
KCTD4Q8WVF5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
KCTD4Q8WVF5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
KCTD4Q8WVF5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
KCTD4Q8WVF5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
KCTD4Q8WVF5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
KCTD4Q8WVF5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
KCTD4Q8WVF5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
KCTD4Q8WVF5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
KCTD4Q8WVF5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
KCTD4Q8WVF5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
KCTD4Q8WVF5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
KCTD4Q8WVF5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
KCTD4Q8WVF5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
KCTD4Q8WVF5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
KCTD4Q8WVF5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
KCTD4Q8WVF5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
KCTD4Q8WVF5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
KCTD4Q8WVF5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KCTD4Q8WVF5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KCTD4Q8WVF5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
KCTD4Q8WVF5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
KCTD4Q8WVF5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KCTD4Q8WVF5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KCTD4Q8WVF5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KCTD4Q8WVF5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KCTD4Q8WVF5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KCTD4Q8WVF5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KCTD4Q8WVF5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
KCTD4Q8WVF5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KCTD4Q8WVF5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KCTD4Q8WVF5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KCTD4Q8WVF5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KCTD4Q8WVF5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KCTD4Q8WVF5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KCTD4Q8WVF5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
KCTD4Q8WVF5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KCTD4Q8WVF5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KCTD4Q8WVF5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KCTD4Q8WVF5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCTD4Q8WVF5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KCTD4Q8WVF5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KCTD4Q8WVF5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KCTD4Q8WVF5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCTD4Q8WVF5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCTD4Q8WVF5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCTD4Q8WVF5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCTD4Q8WVF5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KCTD4Q8WVF5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCTD4Q8WVF5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCTD4Q8WVF5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KCTD4Q8WVF5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KCTD4Q8WVF5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KCTD4Q8WVF5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KCTD4Q8WVF5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KCTD4Q8WVF5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KCTD4Q8WVF5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KCTD4Q8WVF5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KCTD4Q8WVF5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KCTD4Q8WVF5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
KCTD4Q8WVF5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCTD4Q8WVF5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCTD4Q8WVF5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KCTD4Q8WVF5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
KCTD4Q8WVF5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KCTD4Q8WVF5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KCTD4Q8WVF5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCTD4Q8WVF5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCTD4Q8WVF5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCTD4Q8WVF5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KCTD4Q8WVF5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCTD4Q8WVF5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
KCTD4Q8WVF5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KCTD4Q8WVF5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 244.8 ms