Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB1

DCAF11, DDB1- and CUL4-associated factor 11, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF11Q8TEB1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC49.67■■■■■ 5.54
DCAF11Q8TEB1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.34■■■■■ 5.33
DCAF11Q8TEB1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC48.24■■■■■ 5.31
DCAF11Q8TEB1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.2■■■■■ 5.31
DCAF11Q8TEB1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.06■■■■■ 5.28
DCAF11Q8TEB1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.03■■■■■ 5.28
DCAF11Q8TEB1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC47.93■■■■■ 5.26
DCAF11Q8TEB1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.43■■■■■ 5.18
DCAF11Q8TEB1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC46.71■■■■■ 5.07
DCAF11Q8TEB1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
DCAF11Q8TEB1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC46.4■■■■■ 5.02
DCAF11Q8TEB1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.35■■■■■ 5.01
DCAF11Q8TEB1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.33■■■■■ 5.01
DCAF11Q8TEB1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC46.3■■■■■ 5
DCAF11Q8TEB1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC46.11■■■■■ 4.97
DCAF11Q8TEB1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC46.03■■■■■ 4.96
DCAF11Q8TEB1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC46.01■■■■■ 4.96
DCAF11Q8TEB1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.92■■■■■ 4.94
DCAF11Q8TEB1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.85■■■■■ 4.93
DCAF11Q8TEB1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.52■■■■■ 4.88
DCAF11Q8TEB1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC45.44■■■■■ 4.87
DCAF11Q8TEB1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
DCAF11Q8TEB1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
DCAF11Q8TEB1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
DCAF11Q8TEB1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
DCAF11Q8TEB1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
DCAF11Q8TEB1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
DCAF11Q8TEB1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
DCAF11Q8TEB1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC44.69■■■■■ 4.74
DCAF11Q8TEB1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.73
DCAF11Q8TEB1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC44.6■■■■■ 4.73
DCAF11Q8TEB1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
DCAF11Q8TEB1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
DCAF11Q8TEB1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.41■■■■■ 4.7
DCAF11Q8TEB1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC44.32■■■■■ 4.68
DCAF11Q8TEB1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
DCAF11Q8TEB1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
DCAF11Q8TEB1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC44■■■■■ 4.63
DCAF11Q8TEB1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
DCAF11Q8TEB1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
DCAF11Q8TEB1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.82■■■■■ 4.61
DCAF11Q8TEB1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC43.82■■■■■ 4.61
DCAF11Q8TEB1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
DCAF11Q8TEB1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC43.75■■■■■ 4.59
DCAF11Q8TEB1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC43.65■■■■■ 4.58
DCAF11Q8TEB1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
DCAF11Q8TEB1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC43.64■■■■■ 4.58
DCAF11Q8TEB1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.63■■■■■ 4.57
DCAF11Q8TEB1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.55■■■■■ 4.56
DCAF11Q8TEB1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC43.51■■■■■ 4.56
DCAF11Q8TEB1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.42■■■■■ 4.54
DCAF11Q8TEB1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC43.4■■■■■ 4.54
DCAF11Q8TEB1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.37■■■■■ 4.53
DCAF11Q8TEB1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC43.34■■■■■ 4.53
DCAF11Q8TEB1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
DCAF11Q8TEB1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
DCAF11Q8TEB1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.16■■■■■ 4.5
DCAF11Q8TEB1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
DCAF11Q8TEB1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC43.11■■■■■ 4.49
DCAF11Q8TEB1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC43.08■■■■■ 4.49
DCAF11Q8TEB1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
DCAF11Q8TEB1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
DCAF11Q8TEB1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
DCAF11Q8TEB1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.44
DCAF11Q8TEB1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
DCAF11Q8TEB1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC42.75■■■■■ 4.43
DCAF11Q8TEB1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
DCAF11Q8TEB1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC42.62■■■■■ 4.41
DCAF11Q8TEB1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
DCAF11Q8TEB1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
DCAF11Q8TEB1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
DCAF11Q8TEB1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC42.47■■■■■ 4.39
DCAF11Q8TEB1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
DCAF11Q8TEB1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC42.4■■■■■ 4.38
DCAF11Q8TEB1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.34■■■■■ 4.37
DCAF11Q8TEB1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
DCAF11Q8TEB1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
DCAF11Q8TEB1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
DCAF11Q8TEB1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
DCAF11Q8TEB1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC42.3■■■■■ 4.36
DCAF11Q8TEB1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
DCAF11Q8TEB1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
DCAF11Q8TEB1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
DCAF11Q8TEB1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.25■■■■■ 4.35
DCAF11Q8TEB1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.19■■■■■ 4.34
DCAF11Q8TEB1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
DCAF11Q8TEB1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
DCAF11Q8TEB1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
DCAF11Q8TEB1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
DCAF11Q8TEB1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC42.09■■■■■ 4.33
DCAF11Q8TEB1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
DCAF11Q8TEB1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.04■■■■■ 4.32
DCAF11Q8TEB1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
DCAF11Q8TEB1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC42.03■■■■■ 4.32
DCAF11Q8TEB1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
DCAF11Q8TEB1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.95■■■■■ 4.31
DCAF11Q8TEB1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC41.95■■■■■ 4.31
DCAF11Q8TEB1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.3
DCAF11Q8TEB1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
DCAF11Q8TEB1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC41.93■■■■■ 4.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms