Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHG7

SVIP, Small VCP/p97-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVIPQ8NHG7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SVIPQ8NHG7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SVIPQ8NHG7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SVIPQ8NHG7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SVIPQ8NHG7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SVIPQ8NHG7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SVIPQ8NHG7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SVIPQ8NHG7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SVIPQ8NHG7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SVIPQ8NHG7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SVIPQ8NHG7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SVIPQ8NHG7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SVIPQ8NHG7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SVIPQ8NHG7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SVIPQ8NHG7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SVIPQ8NHG7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SVIPQ8NHG7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SVIPQ8NHG7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SVIPQ8NHG7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SVIPQ8NHG7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SVIPQ8NHG7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SVIPQ8NHG7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SVIPQ8NHG7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SVIPQ8NHG7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SVIPQ8NHG7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SVIPQ8NHG7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SVIPQ8NHG7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SVIPQ8NHG7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SVIPQ8NHG7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SVIPQ8NHG7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SVIPQ8NHG7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SVIPQ8NHG7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SVIPQ8NHG7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SVIPQ8NHG7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SVIPQ8NHG7 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SVIPQ8NHG7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SVIPQ8NHG7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SVIPQ8NHG7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SVIPQ8NHG7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SVIPQ8NHG7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SVIPQ8NHG7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SVIPQ8NHG7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SVIPQ8NHG7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SVIPQ8NHG7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SVIPQ8NHG7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SVIPQ8NHG7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SVIPQ8NHG7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SVIPQ8NHG7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SVIPQ8NHG7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SVIPQ8NHG7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SVIPQ8NHG7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SVIPQ8NHG7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SVIPQ8NHG7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SVIPQ8NHG7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SVIPQ8NHG7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SVIPQ8NHG7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SVIPQ8NHG7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SVIPQ8NHG7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SVIPQ8NHG7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SVIPQ8NHG7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SVIPQ8NHG7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SVIPQ8NHG7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SVIPQ8NHG7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SVIPQ8NHG7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SVIPQ8NHG7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SVIPQ8NHG7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SVIPQ8NHG7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SVIPQ8NHG7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SVIPQ8NHG7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SVIPQ8NHG7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SVIPQ8NHG7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SVIPQ8NHG7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SVIPQ8NHG7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SVIPQ8NHG7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SVIPQ8NHG7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SVIPQ8NHG7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SVIPQ8NHG7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SVIPQ8NHG7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SVIPQ8NHG7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SVIPQ8NHG7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SVIPQ8NHG7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SVIPQ8NHG7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SVIPQ8NHG7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SVIPQ8NHG7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SVIPQ8NHG7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SVIPQ8NHG7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SVIPQ8NHG7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SVIPQ8NHG7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SVIPQ8NHG7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SVIPQ8NHG7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SVIPQ8NHG7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SVIPQ8NHG7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SVIPQ8NHG7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SVIPQ8NHG7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SVIPQ8NHG7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SVIPQ8NHG7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SVIPQ8NHG7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SVIPQ8NHG7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SVIPQ8NHG7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SVIPQ8NHG7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms