Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP29

PQLC2, Lysosomal amino acid transporter 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PQLC2Q6ZP29 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PQLC2Q6ZP29 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PQLC2Q6ZP29 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PQLC2Q6ZP29 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PQLC2Q6ZP29 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PQLC2Q6ZP29 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PQLC2Q6ZP29 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PQLC2Q6ZP29 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PQLC2Q6ZP29 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PQLC2Q6ZP29 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PQLC2Q6ZP29 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PQLC2Q6ZP29 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PQLC2Q6ZP29 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PQLC2Q6ZP29 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PQLC2Q6ZP29 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PQLC2Q6ZP29 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PQLC2Q6ZP29 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PQLC2Q6ZP29 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PQLC2Q6ZP29 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PQLC2Q6ZP29 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PQLC2Q6ZP29 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PQLC2Q6ZP29 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PQLC2Q6ZP29 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PQLC2Q6ZP29 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PQLC2Q6ZP29 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PQLC2Q6ZP29 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PQLC2Q6ZP29 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PQLC2Q6ZP29 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PQLC2Q6ZP29 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PQLC2Q6ZP29 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PQLC2Q6ZP29 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PQLC2Q6ZP29 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PQLC2Q6ZP29 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PQLC2Q6ZP29 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PQLC2Q6ZP29 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PQLC2Q6ZP29 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PQLC2Q6ZP29 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PQLC2Q6ZP29 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PQLC2Q6ZP29 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PQLC2Q6ZP29 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PQLC2Q6ZP29 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PQLC2Q6ZP29 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PQLC2Q6ZP29 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PQLC2Q6ZP29 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PQLC2Q6ZP29 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PQLC2Q6ZP29 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PQLC2Q6ZP29 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PQLC2Q6ZP29 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PQLC2Q6ZP29 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PQLC2Q6ZP29 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PQLC2Q6ZP29 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PQLC2Q6ZP29 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PQLC2Q6ZP29 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PQLC2Q6ZP29 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PQLC2Q6ZP29 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PQLC2Q6ZP29 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PQLC2Q6ZP29 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PQLC2Q6ZP29 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PQLC2Q6ZP29 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PQLC2Q6ZP29 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PQLC2Q6ZP29 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PQLC2Q6ZP29 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PQLC2Q6ZP29 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PQLC2Q6ZP29 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PQLC2Q6ZP29 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PQLC2Q6ZP29 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PQLC2Q6ZP29 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PQLC2Q6ZP29 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PQLC2Q6ZP29 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PQLC2Q6ZP29 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PQLC2Q6ZP29 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PQLC2Q6ZP29 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PQLC2Q6ZP29 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PQLC2Q6ZP29 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PQLC2Q6ZP29 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PQLC2Q6ZP29 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PQLC2Q6ZP29 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PQLC2Q6ZP29 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PQLC2Q6ZP29 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PQLC2Q6ZP29 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PQLC2Q6ZP29 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PQLC2Q6ZP29 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PQLC2Q6ZP29 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PQLC2Q6ZP29 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PQLC2Q6ZP29 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PQLC2Q6ZP29 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PQLC2Q6ZP29 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PQLC2Q6ZP29 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PQLC2Q6ZP29 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PQLC2Q6ZP29 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PQLC2Q6ZP29 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PQLC2Q6ZP29 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PQLC2Q6ZP29 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PQLC2Q6ZP29 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PQLC2Q6ZP29 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PQLC2Q6ZP29 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PQLC2Q6ZP29 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PQLC2Q6ZP29 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PQLC2Q6ZP29 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PQLC2Q6ZP29 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms