Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
CASP12Q6UXS9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CASP12Q6UXS9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CASP12Q6UXS9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CASP12Q6UXS9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CASP12Q6UXS9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CASP12Q6UXS9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CASP12Q6UXS9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CASP12Q6UXS9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CASP12Q6UXS9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CASP12Q6UXS9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CASP12Q6UXS9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CASP12Q6UXS9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CASP12Q6UXS9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CASP12Q6UXS9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CASP12Q6UXS9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CASP12Q6UXS9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CASP12Q6UXS9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CASP12Q6UXS9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CASP12Q6UXS9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CASP12Q6UXS9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CASP12Q6UXS9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CASP12Q6UXS9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CASP12Q6UXS9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CASP12Q6UXS9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CASP12Q6UXS9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CASP12Q6UXS9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CASP12Q6UXS9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CASP12Q6UXS9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CASP12Q6UXS9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CASP12Q6UXS9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CASP12Q6UXS9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CASP12Q6UXS9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CASP12Q6UXS9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CASP12Q6UXS9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CASP12Q6UXS9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASP12Q6UXS9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CASP12Q6UXS9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CASP12Q6UXS9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CASP12Q6UXS9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CASP12Q6UXS9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CASP12Q6UXS9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CASP12Q6UXS9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CASP12Q6UXS9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASP12Q6UXS9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CASP12Q6UXS9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CASP12Q6UXS9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CASP12Q6UXS9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CASP12Q6UXS9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CASP12Q6UXS9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CASP12Q6UXS9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CASP12Q6UXS9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CASP12Q6UXS9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASP12Q6UXS9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASP12Q6UXS9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASP12Q6UXS9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASP12Q6UXS9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CASP12Q6UXS9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CASP12Q6UXS9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CASP12Q6UXS9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CASP12Q6UXS9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CASP12Q6UXS9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CASP12Q6UXS9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CASP12Q6UXS9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CASP12Q6UXS9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CASP12Q6UXS9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CASP12Q6UXS9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CASP12Q6UXS9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASP12Q6UXS9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CASP12Q6UXS9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASP12Q6UXS9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CASP12Q6UXS9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CASP12Q6UXS9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CASP12Q6UXS9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CASP12Q6UXS9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CASP12Q6UXS9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CASP12Q6UXS9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASP12Q6UXS9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CASP12Q6UXS9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CASP12Q6UXS9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CASP12Q6UXS9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASP12Q6UXS9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CASP12Q6UXS9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASP12Q6UXS9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CASP12Q6UXS9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CASP12Q6UXS9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CASP12Q6UXS9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CASP12Q6UXS9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CASP12Q6UXS9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CASP12Q6UXS9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CASP12Q6UXS9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CASP12Q6UXS9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CASP12Q6UXS9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CASP12Q6UXS9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CASP12Q6UXS9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CASP12Q6UXS9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CASP12Q6UXS9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASP12Q6UXS9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CASP12Q6UXS9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CASP12Q6UXS9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms