Protein–RNA interactions for Protein: Q68CK6

ACSM2B, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM2B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM2BQ68CK6 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ACSM2BQ68CK6 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ACSM2BQ68CK6 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
ACSM2BQ68CK6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ACSM2BQ68CK6 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ACSM2BQ68CK6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
ACSM2BQ68CK6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ACSM2BQ68CK6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
ACSM2BQ68CK6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ACSM2BQ68CK6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ACSM2BQ68CK6 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ACSM2BQ68CK6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ACSM2BQ68CK6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ACSM2BQ68CK6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ACSM2BQ68CK6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ACSM2BQ68CK6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ACSM2BQ68CK6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ACSM2BQ68CK6 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ACSM2BQ68CK6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ACSM2BQ68CK6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ACSM2BQ68CK6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ACSM2BQ68CK6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ACSM2BQ68CK6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ACSM2BQ68CK6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ACSM2BQ68CK6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ACSM2BQ68CK6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ACSM2BQ68CK6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ACSM2BQ68CK6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ACSM2BQ68CK6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ACSM2BQ68CK6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ACSM2BQ68CK6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ACSM2BQ68CK6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ACSM2BQ68CK6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ACSM2BQ68CK6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ACSM2BQ68CK6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ACSM2BQ68CK6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ACSM2BQ68CK6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ACSM2BQ68CK6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ACSM2BQ68CK6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ACSM2BQ68CK6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ACSM2BQ68CK6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ACSM2BQ68CK6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ACSM2BQ68CK6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ACSM2BQ68CK6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ACSM2BQ68CK6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ACSM2BQ68CK6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ACSM2BQ68CK6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ACSM2BQ68CK6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ACSM2BQ68CK6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ACSM2BQ68CK6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ACSM2BQ68CK6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ACSM2BQ68CK6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ACSM2BQ68CK6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ACSM2BQ68CK6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ACSM2BQ68CK6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ACSM2BQ68CK6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ACSM2BQ68CK6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ACSM2BQ68CK6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ACSM2BQ68CK6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ACSM2BQ68CK6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ACSM2BQ68CK6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ACSM2BQ68CK6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACSM2BQ68CK6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACSM2BQ68CK6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACSM2BQ68CK6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ACSM2BQ68CK6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ACSM2BQ68CK6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ACSM2BQ68CK6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ACSM2BQ68CK6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ACSM2BQ68CK6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ACSM2BQ68CK6 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ACSM2BQ68CK6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ACSM2BQ68CK6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ACSM2BQ68CK6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACSM2BQ68CK6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ACSM2BQ68CK6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ACSM2BQ68CK6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ACSM2BQ68CK6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ACSM2BQ68CK6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ACSM2BQ68CK6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ACSM2BQ68CK6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ACSM2BQ68CK6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ACSM2BQ68CK6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ACSM2BQ68CK6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ACSM2BQ68CK6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ACSM2BQ68CK6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ACSM2BQ68CK6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ACSM2BQ68CK6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ACSM2BQ68CK6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ACSM2BQ68CK6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ACSM2BQ68CK6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ACSM2BQ68CK6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ACSM2BQ68CK6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ACSM2BQ68CK6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ACSM2BQ68CK6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ACSM2BQ68CK6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ACSM2BQ68CK6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ACSM2BQ68CK6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ACSM2BQ68CK6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ACSM2BQ68CK6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 6.9 ms