Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUM1

SDHAF4, Succinate dehydrogenase assembly factor 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF4Q5VUM1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SDHAF4Q5VUM1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SDHAF4Q5VUM1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SDHAF4Q5VUM1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SDHAF4Q5VUM1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SDHAF4Q5VUM1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SDHAF4Q5VUM1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
SDHAF4Q5VUM1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SDHAF4Q5VUM1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SDHAF4Q5VUM1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SDHAF4Q5VUM1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SDHAF4Q5VUM1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SDHAF4Q5VUM1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SDHAF4Q5VUM1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SDHAF4Q5VUM1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
SDHAF4Q5VUM1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SDHAF4Q5VUM1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SDHAF4Q5VUM1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SDHAF4Q5VUM1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SDHAF4Q5VUM1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SDHAF4Q5VUM1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SDHAF4Q5VUM1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SDHAF4Q5VUM1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SDHAF4Q5VUM1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SDHAF4Q5VUM1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SDHAF4Q5VUM1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SDHAF4Q5VUM1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SDHAF4Q5VUM1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SDHAF4Q5VUM1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SDHAF4Q5VUM1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SDHAF4Q5VUM1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SDHAF4Q5VUM1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SDHAF4Q5VUM1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
SDHAF4Q5VUM1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SDHAF4Q5VUM1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SDHAF4Q5VUM1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SDHAF4Q5VUM1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SDHAF4Q5VUM1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
SDHAF4Q5VUM1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SDHAF4Q5VUM1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SDHAF4Q5VUM1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SDHAF4Q5VUM1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SDHAF4Q5VUM1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SDHAF4Q5VUM1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SDHAF4Q5VUM1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SDHAF4Q5VUM1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SDHAF4Q5VUM1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SDHAF4Q5VUM1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
SDHAF4Q5VUM1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
SDHAF4Q5VUM1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SDHAF4Q5VUM1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
SDHAF4Q5VUM1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SDHAF4Q5VUM1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SDHAF4Q5VUM1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
SDHAF4Q5VUM1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SDHAF4Q5VUM1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SDHAF4Q5VUM1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SDHAF4Q5VUM1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SDHAF4Q5VUM1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SDHAF4Q5VUM1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SDHAF4Q5VUM1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SDHAF4Q5VUM1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SDHAF4Q5VUM1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SDHAF4Q5VUM1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SDHAF4Q5VUM1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SDHAF4Q5VUM1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SDHAF4Q5VUM1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SDHAF4Q5VUM1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SDHAF4Q5VUM1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SDHAF4Q5VUM1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SDHAF4Q5VUM1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SDHAF4Q5VUM1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SDHAF4Q5VUM1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
SDHAF4Q5VUM1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SDHAF4Q5VUM1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SDHAF4Q5VUM1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SDHAF4Q5VUM1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SDHAF4Q5VUM1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SDHAF4Q5VUM1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SDHAF4Q5VUM1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SDHAF4Q5VUM1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SDHAF4Q5VUM1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SDHAF4Q5VUM1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SDHAF4Q5VUM1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SDHAF4Q5VUM1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SDHAF4Q5VUM1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SDHAF4Q5VUM1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SDHAF4Q5VUM1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SDHAF4Q5VUM1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SDHAF4Q5VUM1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SDHAF4Q5VUM1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SDHAF4Q5VUM1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SDHAF4Q5VUM1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SDHAF4Q5VUM1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
SDHAF4Q5VUM1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SDHAF4Q5VUM1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SDHAF4Q5VUM1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SDHAF4Q5VUM1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SDHAF4Q5VUM1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SDHAF4Q5VUM1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms