Protein–RNA interactions for Protein: Q5T870

PRR9, Proline-rich protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR9Q5T870 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRR9Q5T870 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRR9Q5T870 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRR9Q5T870 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PRR9Q5T870 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRR9Q5T870 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRR9Q5T870 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRR9Q5T870 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRR9Q5T870 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRR9Q5T870 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRR9Q5T870 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRR9Q5T870 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRR9Q5T870 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRR9Q5T870 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRR9Q5T870 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRR9Q5T870 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRR9Q5T870 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRR9Q5T870 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRR9Q5T870 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRR9Q5T870 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRR9Q5T870 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRR9Q5T870 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRR9Q5T870 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRR9Q5T870 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRR9Q5T870 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRR9Q5T870 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRR9Q5T870 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRR9Q5T870 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRR9Q5T870 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRR9Q5T870 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRR9Q5T870 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRR9Q5T870 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRR9Q5T870 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRR9Q5T870 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRR9Q5T870 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRR9Q5T870 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRR9Q5T870 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRR9Q5T870 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRR9Q5T870 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRR9Q5T870 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRR9Q5T870 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRR9Q5T870 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR9Q5T870 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR9Q5T870 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR9Q5T870 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRR9Q5T870 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRR9Q5T870 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRR9Q5T870 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRR9Q5T870 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRR9Q5T870 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRR9Q5T870 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRR9Q5T870 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRR9Q5T870 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRR9Q5T870 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRR9Q5T870 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRR9Q5T870 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRR9Q5T870 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRR9Q5T870 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRR9Q5T870 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRR9Q5T870 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRR9Q5T870 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRR9Q5T870 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRR9Q5T870 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRR9Q5T870 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRR9Q5T870 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRR9Q5T870 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRR9Q5T870 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRR9Q5T870 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRR9Q5T870 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRR9Q5T870 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRR9Q5T870 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRR9Q5T870 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRR9Q5T870 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRR9Q5T870 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRR9Q5T870 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRR9Q5T870 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRR9Q5T870 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRR9Q5T870 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRR9Q5T870 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRR9Q5T870 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRR9Q5T870 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRR9Q5T870 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRR9Q5T870 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRR9Q5T870 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRR9Q5T870 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRR9Q5T870 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRR9Q5T870 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PRR9Q5T870 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRR9Q5T870 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRR9Q5T870 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRR9Q5T870 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRR9Q5T870 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRR9Q5T870 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRR9Q5T870 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRR9Q5T870 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRR9Q5T870 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRR9Q5T870 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRR9Q5T870 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRR9Q5T870 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRR9Q5T870 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms