Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ09

SPANXN3, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N3, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN3Q5MJ09 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SPANXN3Q5MJ09 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
SPANXN3Q5MJ09 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
SPANXN3Q5MJ09 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SPANXN3Q5MJ09 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SPANXN3Q5MJ09 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SPANXN3Q5MJ09 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SPANXN3Q5MJ09 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SPANXN3Q5MJ09 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SPANXN3Q5MJ09 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SPANXN3Q5MJ09 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SPANXN3Q5MJ09 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SPANXN3Q5MJ09 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SPANXN3Q5MJ09 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SPANXN3Q5MJ09 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SPANXN3Q5MJ09 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SPANXN3Q5MJ09 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SPANXN3Q5MJ09 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SPANXN3Q5MJ09 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SPANXN3Q5MJ09 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SPANXN3Q5MJ09 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SPANXN3Q5MJ09 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SPANXN3Q5MJ09 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SPANXN3Q5MJ09 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SPANXN3Q5MJ09 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SPANXN3Q5MJ09 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SPANXN3Q5MJ09 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SPANXN3Q5MJ09 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SPANXN3Q5MJ09 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SPANXN3Q5MJ09 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SPANXN3Q5MJ09 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SPANXN3Q5MJ09 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SPANXN3Q5MJ09 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SPANXN3Q5MJ09 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SPANXN3Q5MJ09 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SPANXN3Q5MJ09 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SPANXN3Q5MJ09 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SPANXN3Q5MJ09 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SPANXN3Q5MJ09 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SPANXN3Q5MJ09 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SPANXN3Q5MJ09 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SPANXN3Q5MJ09 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SPANXN3Q5MJ09 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SPANXN3Q5MJ09 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SPANXN3Q5MJ09 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SPANXN3Q5MJ09 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SPANXN3Q5MJ09 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SPANXN3Q5MJ09 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SPANXN3Q5MJ09 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SPANXN3Q5MJ09 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SPANXN3Q5MJ09 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SPANXN3Q5MJ09 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SPANXN3Q5MJ09 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SPANXN3Q5MJ09 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SPANXN3Q5MJ09 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SPANXN3Q5MJ09 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SPANXN3Q5MJ09 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SPANXN3Q5MJ09 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SPANXN3Q5MJ09 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SPANXN3Q5MJ09 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SPANXN3Q5MJ09 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SPANXN3Q5MJ09 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SPANXN3Q5MJ09 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SPANXN3Q5MJ09 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SPANXN3Q5MJ09 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SPANXN3Q5MJ09 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SPANXN3Q5MJ09 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SPANXN3Q5MJ09 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SPANXN3Q5MJ09 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SPANXN3Q5MJ09 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SPANXN3Q5MJ09 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SPANXN3Q5MJ09 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SPANXN3Q5MJ09 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SPANXN3Q5MJ09 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SPANXN3Q5MJ09 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SPANXN3Q5MJ09 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SPANXN3Q5MJ09 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SPANXN3Q5MJ09 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SPANXN3Q5MJ09 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SPANXN3Q5MJ09 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SPANXN3Q5MJ09 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SPANXN3Q5MJ09 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SPANXN3Q5MJ09 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SPANXN3Q5MJ09 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SPANXN3Q5MJ09 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SPANXN3Q5MJ09 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SPANXN3Q5MJ09 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SPANXN3Q5MJ09 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SPANXN3Q5MJ09 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SPANXN3Q5MJ09 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SPANXN3Q5MJ09 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SPANXN3Q5MJ09 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SPANXN3Q5MJ09 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SPANXN3Q5MJ09 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SPANXN3Q5MJ09 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SPANXN3Q5MJ09 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SPANXN3Q5MJ09 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPANXN3Q5MJ09 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SPANXN3Q5MJ09 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPANXN3Q5MJ09 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms