Protein–RNA interactions for Protein: Q562R1

ACTBL2, Beta-actin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBL2Q562R1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ACTBL2Q562R1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ACTBL2Q562R1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ACTBL2Q562R1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ACTBL2Q562R1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ACTBL2Q562R1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ACTBL2Q562R1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ACTBL2Q562R1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ACTBL2Q562R1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
ACTBL2Q562R1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ACTBL2Q562R1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACTBL2Q562R1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ACTBL2Q562R1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ACTBL2Q562R1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ACTBL2Q562R1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ACTBL2Q562R1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ACTBL2Q562R1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ACTBL2Q562R1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ACTBL2Q562R1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ACTBL2Q562R1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ACTBL2Q562R1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACTBL2Q562R1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACTBL2Q562R1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACTBL2Q562R1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACTBL2Q562R1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ACTBL2Q562R1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ACTBL2Q562R1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACTBL2Q562R1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACTBL2Q562R1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACTBL2Q562R1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ACTBL2Q562R1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACTBL2Q562R1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACTBL2Q562R1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACTBL2Q562R1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ACTBL2Q562R1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACTBL2Q562R1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACTBL2Q562R1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACTBL2Q562R1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACTBL2Q562R1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACTBL2Q562R1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACTBL2Q562R1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACTBL2Q562R1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACTBL2Q562R1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACTBL2Q562R1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACTBL2Q562R1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTBL2Q562R1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTBL2Q562R1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACTBL2Q562R1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACTBL2Q562R1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACTBL2Q562R1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACTBL2Q562R1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACTBL2Q562R1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACTBL2Q562R1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTBL2Q562R1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACTBL2Q562R1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACTBL2Q562R1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACTBL2Q562R1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACTBL2Q562R1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTBL2Q562R1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACTBL2Q562R1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACTBL2Q562R1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTBL2Q562R1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTBL2Q562R1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTBL2Q562R1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTBL2Q562R1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACTBL2Q562R1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTBL2Q562R1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTBL2Q562R1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTBL2Q562R1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTBL2Q562R1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTBL2Q562R1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTBL2Q562R1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTBL2Q562R1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTBL2Q562R1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTBL2Q562R1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTBL2Q562R1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTBL2Q562R1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACTBL2Q562R1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTBL2Q562R1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTBL2Q562R1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACTBL2Q562R1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACTBL2Q562R1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTBL2Q562R1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTBL2Q562R1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTBL2Q562R1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTBL2Q562R1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTBL2Q562R1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTBL2Q562R1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTBL2Q562R1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTBL2Q562R1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTBL2Q562R1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTBL2Q562R1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTBL2Q562R1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTBL2Q562R1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACTBL2Q562R1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACTBL2Q562R1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACTBL2Q562R1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACTBL2Q562R1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTBL2Q562R1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTBL2Q562R1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms