Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.39■■■■□ 3.42
DDR2Q16832 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
DDR2Q16832 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
DDR2Q16832 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
DDR2Q16832 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
DDR2Q16832 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
DDR2Q16832 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
DDR2Q16832 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
DDR2Q16832 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
DDR2Q16832 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
DDR2Q16832 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
DDR2Q16832 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
DDR2Q16832 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
DDR2Q16832 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
DDR2Q16832 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
DDR2Q16832 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
DDR2Q16832 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
DDR2Q16832 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
DDR2Q16832 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
DDR2Q16832 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
DDR2Q16832 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
DDR2Q16832 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
DDR2Q16832 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
DDR2Q16832 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
DDR2Q16832 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
DDR2Q16832 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
DDR2Q16832 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
DDR2Q16832 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
DDR2Q16832 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
DDR2Q16832 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
DDR2Q16832 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
DDR2Q16832 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
DDR2Q16832 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
DDR2Q16832 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
DDR2Q16832 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
DDR2Q16832 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
DDR2Q16832 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
DDR2Q16832 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
DDR2Q16832 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
DDR2Q16832 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
DDR2Q16832 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
DDR2Q16832 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
DDR2Q16832 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
DDR2Q16832 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
DDR2Q16832 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
DDR2Q16832 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
DDR2Q16832 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
DDR2Q16832 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
DDR2Q16832 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
DDR2Q16832 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
DDR2Q16832 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
DDR2Q16832 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
DDR2Q16832 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
DDR2Q16832 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
DDR2Q16832 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
DDR2Q16832 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
DDR2Q16832 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
DDR2Q16832 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
DDR2Q16832 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
DDR2Q16832 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
DDR2Q16832 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
DDR2Q16832 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
DDR2Q16832 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
DDR2Q16832 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
DDR2Q16832 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
DDR2Q16832 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
DDR2Q16832 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
DDR2Q16832 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
DDR2Q16832 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
DDR2Q16832 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
DDR2Q16832 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
DDR2Q16832 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
DDR2Q16832 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
DDR2Q16832 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
DDR2Q16832 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
DDR2Q16832 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
DDR2Q16832 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
DDR2Q16832 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
DDR2Q16832 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
DDR2Q16832 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
DDR2Q16832 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
DDR2Q16832 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
DDR2Q16832 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
DDR2Q16832 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
DDR2Q16832 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
DDR2Q16832 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
DDR2Q16832 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
DDR2Q16832 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
DDR2Q16832 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
DDR2Q16832 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
DDR2Q16832 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
DDR2Q16832 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
DDR2Q16832 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
DDR2Q16832 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
DDR2Q16832 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
DDR2Q16832 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
DDR2Q16832 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
DDR2Q16832 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
DDR2Q16832 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
DDR2Q16832 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms