Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERC1Q15751 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERC1Q15751 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERC1Q15751 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERC1Q15751 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERC1Q15751 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERC1Q15751 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERC1Q15751 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERC1Q15751 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERC1Q15751 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERC1Q15751 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERC1Q15751 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERC1Q15751 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HERC1Q15751 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
HERC1Q15751 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HERC1Q15751 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
HERC1Q15751 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERC1Q15751 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERC1Q15751 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERC1Q15751 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERC1Q15751 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERC1Q15751 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERC1Q15751 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HERC1Q15751 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERC1Q15751 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERC1Q15751 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERC1Q15751 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERC1Q15751 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERC1Q15751 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERC1Q15751 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERC1Q15751 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERC1Q15751 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERC1Q15751 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERC1Q15751 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERC1Q15751 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERC1Q15751 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HERC1Q15751 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERC1Q15751 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERC1Q15751 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERC1Q15751 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERC1Q15751 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERC1Q15751 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERC1Q15751 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERC1Q15751 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HERC1Q15751 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERC1Q15751 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERC1Q15751 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERC1Q15751 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERC1Q15751 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HERC1Q15751 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERC1Q15751 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERC1Q15751 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERC1Q15751 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HERC1Q15751 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERC1Q15751 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERC1Q15751 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERC1Q15751 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERC1Q15751 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERC1Q15751 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERC1Q15751 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERC1Q15751 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERC1Q15751 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERC1Q15751 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERC1Q15751 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERC1Q15751 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERC1Q15751 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERC1Q15751 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERC1Q15751 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC1Q15751 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC1Q15751 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERC1Q15751 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERC1Q15751 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERC1Q15751 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERC1Q15751 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERC1Q15751 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERC1Q15751 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERC1Q15751 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERC1Q15751 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERC1Q15751 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HERC1Q15751 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERC1Q15751 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HERC1Q15751 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERC1Q15751 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERC1Q15751 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HERC1Q15751 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HERC1Q15751 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERC1Q15751 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC1Q15751 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERC1Q15751 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERC1Q15751 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERC1Q15751 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERC1Q15751 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERC1Q15751 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERC1Q15751 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERC1Q15751 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC1Q15751 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC1Q15751 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC1Q15751 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC1Q15751 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC1Q15751 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
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