Protein–RNA interactions for Protein: Q15303

ERBB4, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB4Q15303 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC44.26■■■■■ 4.68
ERBB4Q15303 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC43.3■■■■■ 4.52
ERBB4Q15303 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
ERBB4Q15303 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
ERBB4Q15303 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
ERBB4Q15303 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.74■■■■■ 4.43
ERBB4Q15303 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC42.57■■■■■ 4.41
ERBB4Q15303 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.53■■■■■ 4.4
ERBB4Q15303 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
ERBB4Q15303 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
ERBB4Q15303 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
ERBB4Q15303 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.21
ERBB4Q15303 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
ERBB4Q15303 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC41.24■■■■■ 4.19
ERBB4Q15303 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC41.21■■■■■ 4.19
ERBB4Q15303 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
ERBB4Q15303 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
ERBB4Q15303 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
ERBB4Q15303 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
ERBB4Q15303 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
ERBB4Q15303 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.55■■■■■ 4.08
ERBB4Q15303 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
ERBB4Q15303 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
ERBB4Q15303 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
ERBB4Q15303 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
ERBB4Q15303 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
ERBB4Q15303 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
ERBB4Q15303 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC39.96■■■■□ 3.99
ERBB4Q15303 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
ERBB4Q15303 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
ERBB4Q15303 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.8■■■■□ 3.96
ERBB4Q15303 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
ERBB4Q15303 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
ERBB4Q15303 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
ERBB4Q15303 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
ERBB4Q15303 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
ERBB4Q15303 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
ERBB4Q15303 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC39.32■■■■□ 3.88
ERBB4Q15303 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
ERBB4Q15303 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC39.2■■■■□ 3.87
ERBB4Q15303 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
ERBB4Q15303 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
ERBB4Q15303 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
ERBB4Q15303 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
ERBB4Q15303 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
ERBB4Q15303 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC39.06■■■■□ 3.84
ERBB4Q15303 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
ERBB4Q15303 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
ERBB4Q15303 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC38.66■■■■□ 3.78
ERBB4Q15303 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
ERBB4Q15303 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
ERBB4Q15303 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
ERBB4Q15303 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
ERBB4Q15303 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
ERBB4Q15303 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
ERBB4Q15303 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
ERBB4Q15303 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC38.48■■■■□ 3.75
ERBB4Q15303 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
ERBB4Q15303 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
ERBB4Q15303 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
ERBB4Q15303 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
ERBB4Q15303 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
ERBB4Q15303 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
ERBB4Q15303 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
ERBB4Q15303 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
ERBB4Q15303 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
ERBB4Q15303 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
ERBB4Q15303 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC38.05■■■■□ 3.68
ERBB4Q15303 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
ERBB4Q15303 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC37.99■■■■□ 3.67
ERBB4Q15303 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC37.98■■■■□ 3.67
ERBB4Q15303 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
ERBB4Q15303 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
ERBB4Q15303 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
ERBB4Q15303 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
ERBB4Q15303 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
ERBB4Q15303 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
ERBB4Q15303 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
ERBB4Q15303 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
ERBB4Q15303 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
ERBB4Q15303 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.62
ERBB4Q15303 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
ERBB4Q15303 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
ERBB4Q15303 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
ERBB4Q15303 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
ERBB4Q15303 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
ERBB4Q15303 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
ERBB4Q15303 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
ERBB4Q15303 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
ERBB4Q15303 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
ERBB4Q15303 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
ERBB4Q15303 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
ERBB4Q15303 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
ERBB4Q15303 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
ERBB4Q15303 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
ERBB4Q15303 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
ERBB4Q15303 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
ERBB4Q15303 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
ERBB4Q15303 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
ERBB4Q15303 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
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