Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
NR1I3Q14994 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
NR1I3Q14994 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.43■■■■□ 3.42
NR1I3Q14994 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.28■■■■□ 3.4
NR1I3Q14994 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
NR1I3Q14994 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
NR1I3Q14994 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
NR1I3Q14994 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
NR1I3Q14994 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
NR1I3Q14994 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
NR1I3Q14994 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
NR1I3Q14994 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
NR1I3Q14994 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NR1I3Q14994 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NR1I3Q14994 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NR1I3Q14994 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
NR1I3Q14994 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
NR1I3Q14994 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.14
NR1I3Q14994 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
NR1I3Q14994 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NR1I3Q14994 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NR1I3Q14994 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NR1I3Q14994 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NR1I3Q14994 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NR1I3Q14994 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
NR1I3Q14994 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NR1I3Q14994 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NR1I3Q14994 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NR1I3Q14994 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
NR1I3Q14994 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NR1I3Q14994 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NR1I3Q14994 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
NR1I3Q14994 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NR1I3Q14994 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NR1I3Q14994 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NR1I3Q14994 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NR1I3Q14994 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NR1I3Q14994 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NR1I3Q14994 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NR1I3Q14994 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NR1I3Q14994 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NR1I3Q14994 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NR1I3Q14994 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NR1I3Q14994 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NR1I3Q14994 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
NR1I3Q14994 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NR1I3Q14994 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NR1I3Q14994 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
NR1I3Q14994 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NR1I3Q14994 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
NR1I3Q14994 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NR1I3Q14994 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NR1I3Q14994 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NR1I3Q14994 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NR1I3Q14994 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NR1I3Q14994 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NR1I3Q14994 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NR1I3Q14994 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NR1I3Q14994 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NR1I3Q14994 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NR1I3Q14994 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NR1I3Q14994 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
NR1I3Q14994 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
NR1I3Q14994 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NR1I3Q14994 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NR1I3Q14994 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NR1I3Q14994 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NR1I3Q14994 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NR1I3Q14994 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NR1I3Q14994 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NR1I3Q14994 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NR1I3Q14994 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NR1I3Q14994 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NR1I3Q14994 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NR1I3Q14994 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NR1I3Q14994 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
NR1I3Q14994 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NR1I3Q14994 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NR1I3Q14994 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NR1I3Q14994 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NR1I3Q14994 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NR1I3Q14994 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NR1I3Q14994 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NR1I3Q14994 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NR1I3Q14994 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
NR1I3Q14994 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
NR1I3Q14994 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.91■■■□□ 2.7
NR1I3Q14994 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
NR1I3Q14994 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
NR1I3Q14994 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
NR1I3Q14994 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
NR1I3Q14994 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NR1I3Q14994 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
NR1I3Q14994 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NR1I3Q14994 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NR1I3Q14994 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NR1I3Q14994 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NR1I3Q14994 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NR1I3Q14994 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NR1I3Q14994 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
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